我正在寻找使用python(h5py)将数据附加到h5文件中的现有数据集的可能性.
我的项目简介:我尝试使用医学图像数据训练CNN.由于在将数据转换为nparrays期间需要大量数据和大量内存,我需要将"转换"拆分为几个数据块 - >加载并预处理前100个医学图像并将nparray保存到hdf5 file - >加载下一个100个数据集并附加现有的h5文件.
现在我尝试按如下方式存储前100个转换后的nparrays:
import h5py
from LoadIPV import LoadIPV
X_train_data, Y_train_data, X_test_data, Y_test_data = LoadIPV()
with h5py.File('.\PreprocessedData.h5', 'w') as hf:
hf.create_dataset("X_train", data=X_train_data, maxshape=(None, 512, 512, 9))
hf.create_dataset("X_test", data=X_test_data, maxshape=(None, 512, 512, 9))
hf.create_dataset("Y_train", data=Y_train_data, maxshape=(None, 512, 512, 1))
hf.create_dataset("Y_test", data=Y_test_data, maxshape=(None, 512, 512, 1))
可以看出,转换后的nparray被分成四个不同的"组",存储在四个hdf5数据集[X_train,X_test,Y_train,Y_test]中.LoadIPV()函数执行医学图像数据的预处理.
我的问题是,我想将接下来的100个nparray存储到现有数据集中的同一个h5文件中:这意味着我想要附加例如现有的X_train-dataset [100,512,512,9]以及接下来的100个nparrays这样X_train变为[200,512,512,9].这同样适用于其他三个数据集X_test,Y_train,Y_test.
非常感谢您的帮助!