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维恩图用R?

除了limma包之外,还有用于在R中进行维恩图的其他包装.

有人有提示吗?

这里有关于用limma包做维恩图的一些注意事项.

r venn-diagram

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R在窗户上安装Vennerable包

我无法在我的Windows 7上使用最新的R(2.13.0)从https://r-forge.r-project.org/projects/vennerable/安装Vennerable R软件包.

我试过以下:

  1. 从RGui安装并选择R-Forge repos:
    列表中没有Vennerable包

  2. 使用"从本地zip文件安装包"从RGui安装:

    can not open compressed file 'Vennerable.tar.gz/DESCRIPTION'
    
    Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
  3. 将tar.gz转换为zip并使用"从本地zip文件安装包"从RGui安装:

    can not open compressed file 'Vennerable.tar.gz/DESCRIPTION'
    
    Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
  4. 尝试手动安装: install.packages("D:/Downloads/Vennerable.tar.gz", repos = NULL)

    can not open compressed file 'Vennerable.tar.gz/DESCRIPTION'
    Error in install.packages : cannot open the connection
    
    Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

注意:有一个文件说明.

我该怎么做才能安装这个软件包?


包页面上的链接已经死亡(对于Windows构建包源).

install packages r

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R:可以将rpm文件与Windows一起用于可能过时的R包吗?

我试图运行需要R包'pkgDepTools'和'Rgraphviz'的代码.我收到错误消息,说这两个软件包都不适用于R版本2.15.0.

谷歌搜索出现了以下似乎有这些软件包的网页RPM Pbone:

http://rpm.pbone.net/index.php3/stat/4/idpl/17802118/dir/mandrake_other/com/R-pkgDepTools-1.20.0-1-mdv2012.0.i586.rpm.html

http://rpm.pbone.net/index.php3/stat/4/idpl/17802080/dir/mandrake_other/com/R-Rgraphviz-1.32.0-2-mdv2012.0.i586.rpm.html

但是,文件的扩展名为*.rpm,而不是我习惯的*.tar.gz或*.zip扩展名.

我使用的是Windows 7和R版本2.15.0.我可以从*.rpm文件安装R包吗?

来自维基百科*.rpm似乎可能更适合Linux:

http://en.wikipedia.org/wiki/RPM_Package_Manager

关于其他可能的解决方案,我在这里发现了几个早期的帖子,其中有关于安装R软件包的类似问题,这些软件包不适用于最新版本的R:

R中的双变量泊松回归?

套餐'GeneR'不可用

R Venn Diagram包尊贵不可用 - 替代包裹?

我已经安装了最新版本的Rtools和'devtools'软件包.虽然我对他们一无所知.

这里有一个'Rgraphviz'的存档版本:

http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Rgraphviz/

但我找不到'pkgDepTools'的存档版本.

如果我可以使用上面的*.rpm文件在Windows机器上安装软件包,有人可以提供说明吗?

如果我必须使用Rtools构建它们,我可能会提出更多问题,因为以下链接中的说明对我来说很有挑战性:

http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#Building-from-source

为了完全透明,我希望有人可以为我建造它们,如果可能的话.虽然我认识到自己做的经验和知识,但从长远来看,这可能会得到回报.

谢谢你的任何建议.

r

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