是否有基于FFT的2D互相关或卷积函数内置于scipy(或其他流行的库)?
有这样的功能:
scipy.signal.correlate2d- "实施的直接方法convolveND对于大数据来说会很慢"scipy.ndimage.correlate - "使用精确计算(即不是FFT)将数组与给定内核相关联."scipy.fftpack.convolve.convolve,我真的不明白,但似乎错了numarray有一个correlate2d()带fft=True开关的功能,但我猜numarray被折叠成numpy,我无法找到是否包含此功能.
我想使用python提高卷积的性能,并希望能够对如何最好地提高性能有所了解.
我目前正在使用scipy执行卷积,使用的代码有点像下面的代码片段:
import numpy
import scipy
import scipy.signal
import timeit
a=numpy.array ( [ range(1000000) ] )
a.reshape(1000,1000)
filt=numpy.array( [ [ 1, 1, 1 ], [1, -8, 1], [1,1,1] ] )
def convolve():
global a, filt
scipy.signal.convolve2d ( a, filt, mode="same" )
t=timeit.Timer("convolve()", "from __main__ import convolve")
print "%.2f sec/pass" % (10 * t.timeit(number=10)/100)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我正在处理图像数据,使用灰度(0到255之间的整数值),我目前每个卷积得到大约四分之一秒.我的想法是做以下其中一项:
使用corepy,最好进行一些优化使用icc和ikml重新编译numpy.使用python-cuda.
我想知道是否有人对这些方法有任何经验(什么样的增益是典型的,如果值得花时间),或者是否有人知道有更好的库与Numpy进行卷积.
谢谢!
编辑:
通过使用Numpy在C中重写python循环来加速大约10倍.
我试图使用numpy在python中执行2d卷积
我有一个2d数组,如下所示,行内核为H_r,列为H_c
data = np.zeros((nr, nc), dtype=np.float32)
#fill array with some data here then convolve
for r in range(nr):
data[r,:] = np.convolve(data[r,:], H_r, 'same')
for c in range(nc):
data[:,c] = np.convolve(data[:,c], H_c, 'same')
data = data.astype(np.uint8);
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
它不会产生我期望的输出,这段代码看起来不错,我认为问题在于从float32到8bit的转换.什么是最好的方法来做到这一点
谢谢