将IPython笔记本电脑置于版本控制之下的好策略是什么？

笔记本格式非常适合版本控制:如果想要版本控制笔记本和输出,那么这非常有效.当人们只想对输入进行版本控制时,就会产生烦恼,不包括可能是大型二进制blob的单元格输出(也就是"构建产品"),特别是对于电影和情节.特别是,我试图找到一个良好的工作流程:

允许我选择包括或排除输出,
如果我不想要它会阻止我意外地提交输出,
允许我保持我的本地版本的输出,
允许我看看当我使用我的版本控制系统更改输入时(即如果我只对版本控制输入但我的本地文件有输出,那么我希望能够看到输入是否已更改(需要提交) ).使用版本控制状态命令将始终注册差异,因为本地文件有输出.)
允许我从更新的干净笔记本更新我的工作笔记本(包含输出).(更新)

如上所述,如果我选择包含输出(例如,在使用nbviewer时这是可取的),那么一切都很好.问题是,当我不想要的版本控制输出.有一些工具和脚本可以剥离笔记本的输出,但我经常会遇到以下问题:

我已经考虑过几个选项,我将在下面讨论,但还没有找到一个很好的综合解决方案.完整的解决方案可能需要对IPython进行一些更改,或者可能依赖于一些简单的外部脚本.我目前使用mercurial,但想要一个也适用于git的解决方案:理想的解决方案是版本控制不可知.

这个问题已经多次讨论过,但从用户的角度来看,没有明确或明确的解决方案.这个问题的答案应该提供明确的策略.如果它需要最近的(甚至开发)版本的IPython或一个易于安装的扩展,这很好.

更新:我一直在玩我修改过的笔记本版本,可以选择.clean使用Gregory Crosswhite的建议保存每次保存的版本.这满足了我的大多数约束,但是仍然没有解决以下问题:

这还不是一个标准的解决方案(需要修改ipython源.有没有办法通过简单的扩展来实现这种行为？需要某种on-save钩子.
我对当前工作流程的一个问题是拉动变化.这些将进入.clean文件,然后需要以某种方式集成到我的工作版本中.(当然,我总是可以重新执行笔记本,但这可能会很痛苦,特别是如果某些结果取决于长时间的计算,并行计算等).我还不知道如何解决这个问题.也许涉及像ipycache这样的扩展的工作流可能会起作用,但这似乎有点过于复杂.

笔记

删除(剥离)输出

笔记本电脑运行时,可以使用Cell/All Output/Clear菜单选项删除输出.
有一些用于删除输出的脚本,例如删除输出的脚本nbstripout.py,但不会产生与使用笔记本界面相同的输出.这最终包含在ipython/nbconvert repo中,但是已经关闭,说明这些更改现在包含在ipython/ipython中,但相应的功能似乎还没有包含在内. (更新)话虽如此,Gregory Crosswhite的解决方案显示这很容易做到,即使没有调用ipython/nbconvert因此,如果可以正确地连接它,这种方法可能是可行的.(然而,将它附加到每个版本控制系统似乎不是一个好主意 - 这应该以某种方式挂钩到笔记本机制.)