我想创建一个本地R包存储库,以便我公司的用户可以从中安装包,系统管理员可以定期更新本地存储库.目前拒绝访问CRAN镜像.
有一个简单的方法吗？
有一半的时间，在没有模式的情况下，即使我增加了 max.print 和 R studio 中的全局选项，我也会从输出中省略行。详情如下：
我正在大型数据集（14 个变量的超过 100,000 个观察值）上运行 lmer 模型，包如下：lme4、lmerTest、tidyverse、lsmeans
我有几个单独运行的数据集，但这些数据集在设计上彼此没有什么不同，并且它们都源自同一个母数据集。我只是删除了每个数据集中的某些行来回答不同的问题。每个数据集中的变量包括小时、位置、日期、深度、温度和转换后的深度以满足假设。
由于某种原因，在我运行 lsmeans() 函数进行成对比较后，有一半的时间省略了行：[达到 getOption("max.print") -- 省略 110 行]
示例代码：
ft.model = lmer(dep.variable ~ fixed.factor + (1|random.factor), data = dataset)
anova(ft.model)
plot(ft.model, main = "residuals/fitted ft.model")
lsmeans(ft.model, pairwise~fixed.factor, adjust = "Tukey", max.print = 9999)
所以我的一些变量看起来像这样：
ft.hrdepth = lmer(depth ~ hr + (1|FishID), data = all)
anova(ft.hrdepth)
plot(ft.hrdepth, main = "residuals/fitted ft.hrdepth")
lsmeans(ft.hrdepth, pairwise~hr, adjust = "Tukey", max.print = 9999)
我尝试添加 max.print 参数并增加到 10000、10000000、9999、99999999、Inf 和其他组合。我还进入了 RStudio 设置，并将显示的行数限制更改为类似的数字：工具 > 全局选项 …
我无法从 Github 安装任何 R 包，尽管我之前已经这样做过几次。我已经在 R 版本 3.5.0 和 3.5.1 中尝试过这个。
尝试使用以下方法安装“ https://github.com/rstudio/bookdown/bookdown-master.zip ”：
devtools::install_github('rstudio/bookdown')
githubinstall::githubinstall("bookdown")
或下载并尝试在本地加载...
install_local("/Users/Brian/Documents/bookdown-master.zip")
总是给我错误信息
Error in readLines(f) :
(converted from warning) incomplete final line found on '/Users/Brian/.Rprofile'
我也尝试了其他解决方法，但所有道路似乎都导致此错误消息，而且我找不到任何可以告诉我它与什么相关的信息。
有任何想法吗？
我希望使用Notepad ++编辑器更改来修改Windows 7 R-2.11.1下的Rprofile.site文件
# options(help_type="text")
options(help_type="html")
至
options(help_type="text")
# options(help_type="html")
保存此文件时,编辑器会一直提示以下消息
"Please check whether if this is opened in another program"
我没有其他程序打开这个文件.
有谁知道如何修改和保存这个文件？