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我正在帮助一家兽医诊所测量狗爪下的压力.我使用Python进行数据分析,现在我不得不试图将爪子分成(解剖学)子区域.

我制作了每个爪子的2D阵列,它由爪子随时间加载的每个传感器的最大值组成.这是一个爪子的例子,我用Excel绘制了我想要"检测"的区域.这些是传感器周围的2×2个盒子,具有局部最大值,它们一起具有最大的总和.

所以我尝试了一些实验并决定只查找每列和每行的最大值(由于爪子的形状,不能在一个方向上查看).这似乎可以很好地"检测"单独脚趾的位置,但它也标记了相邻的传感器.

那么告诉Python哪些最大值是我想要的最好的方法是什么？

注意:2x2正方形不能重叠,因为它们必须是单独的脚趾!

我也采用2x2作为方便,欢迎任何更高级的解决方案,但我只是一个人类运动科学家,所以我既不是真正的程序员也不是数学家,所以请保持"简单".

这是一个可以加载的版本np.loadtxt

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结果

所以我尝试了@jextee的解决方案(见下面的结果).正如你所看到的,它在前爪上很有效,但后腿的效果不太好.

更具体地说,它无法识别出第四个脚趾的小峰值.这显然是循环看起来自上而下朝向最低值的事实所固有的,而不考虑这是什么.

有谁知道如何调整@jextee的算法,以便它也可以找到第4个脚趾？

由于我还没有处理任何其他试验,我不能提供任何其他样品.但我之前提供的数据是每只爪子的平均值.该文件是一个数组,其最大数据为9个爪子,它们与盘子接触的顺序.

该图像显示了它们如何在空间上展开.

更新:

我已经为任何感兴趣的人建立了一个博客,我已经设置了一个包含所有原始测量值的SkyDrive.所以对于要求更多数据的人来说:给你更大的力量!

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新更新:

所以在我得到关于爪子检测和爪子分类的问题的帮助后,我终于能够检查每个爪子的脚趾检测!事实证明,除了像我自己的例子中那样大小的爪子之外,它在任何东西上都不能很好地工作.事后看来,任意选择2x2是我自己的错.

这是一个错误的例子:钉子被识别为脚趾,"脚跟"如此宽,它被识别两次!

爪子太大,因此在没有重叠的情况下采用2x2尺寸会导致一些脚趾被检测到两次.相反,在小型犬中,它经常无法找到第五个脚趾,我怀疑它是由2x2区域太大引起的.

在对我的所有测量结果进行了当前的解决方案之后,我得出了令人吃惊的结论:几乎所有的小型犬都没有找到第5个脚趾,并且对于大型犬的50%以上的影响它会发现更多!

显然我需要改变它.我自己的猜测是将neighborhood小型狗的体型改为小型犬,大型犬则更大.但是generate_binary_structure不会让我改变数组的大小.

因此,我希望其他人有更好的建议来定位脚趾,也许脚趾区域尺寸与爪子尺寸一致？

假设我在java中有一个2D累加器数组int[][] array.该数组可能如下所示:

(x和z轴表示数组中的索引,y轴表示值 - 这些是int[56][56]具有0~4500值的图像)

要么

我需要做的是在阵列中找到峰值 - 第一个峰值有2个峰值,第二个阵列有8个峰值.这些峰值总是"明显的"(峰值之间始终存在间隙),但它们不必像这些图像那样相似,它们可能或多或少是随机的 - 这些图像不是基于真实数据,只是样本.真正的阵列可以有5000x5000的大小,峰值从几千到几十......算法必须是通用的,我不知道阵列或峰值有多大,我也不知道那里有多少个峰值是.但我确实知道某种阈值 - 峰值不能小于给定值.

问题是,一个峰可以由附近的几个较小的峰组成(第一个图像),高度可以是非常随机的,并且在一个阵列中大小可以显着不同(大小 - 我的意思是它在阵列中占用的单位数 - 一个峰值可以包含6个单位,其他峰值可以包含90个单位.它也必须快速(所有在1次迭代中完成),阵列可能非常大.

任何帮助表示赞赏 - 我不希望你的代码,只是正确的想法:)谢谢!

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编辑:你询问了域名 - 但它很复杂,而且它无法解决问题.它实际上是一个带有3D点的ArrayLists数组,如ArrayList <Point3D> [] [],并且有问题的值是ArrayList的大小.每个峰包含属于一个簇的点(在这种情况下为平面) - 该数组是算法的结果,该算法对点云进行分段.我需要在峰值中找到最高值,这样我就可以将"最大"的arraylist中的点拟合到一个平面,从中计算一些参数,然后从峰值中正确地聚集大部分点.