相关疑难解决方法(0)

我使用的是Python 3.5.1.我在这里阅读了文档和包部分:https://docs.python.org/3/tutorial/modules.html#packages

现在,我有以下结构:

/home/wujek/Playground/a/b/module.py

module.py:

class Foo:
    def __init__(self):
        print('initializing Foo')

现在,在/home/wujek/Playground:

~/Playground $ python3
>>> import a.b.module
>>> a.b.module.Foo()
initializing Foo
<a.b.module.Foo object at 0x100a8f0b8>

同样,现在在家里,超级文件夹Playground:

~ $ PYTHONPATH=Playground python3
>>> import a.b.module
>>> a.b.module.Foo()
initializing Foo
<a.b.module.Foo object at 0x10a5fee10>

实际上,我可以做各种各样的事情:

~ $ PYTHONPATH=Playground python3
>>> import a
>>> import a.b
>>> import Playground.a.b

为什么这样做？我虽然有被需要的__init__.py文件(空的都可以)两种a,并b为module.py要导入的时候Python的路径指向Playground文件夹？

这似乎已经从Python 2.7改变了:

~ $ PYTHONPATH=Playground …

我正在运行(生物)python脚本,导致以下错误:

from: can't read /var/mail/Bio

看到我的脚本与邮件没有任何关系,我不明白为什么我的脚本在查找/ var/mail.

这里似乎有什么问题？我怀疑它会有所帮助,因为脚本似乎不是问题,但无论如何这里是我的脚本:

from Bio import SeqIO
from Bio.SeqUtils import ProtParam

handle = open("examplefasta.fasta") 
for record in SeqIO.parse(handle, "fasta"): 
    seq = str(record.seq)
    X = ProtParam.ProteinAnalysis(seq)
    print X.count_amino_acids() 
    print X.get_amino_acids_percent() 
    print X.molecular_weight() 
    print X.aromaticity() 
    print X.instability_index() 
    print X.flexibility() 
    print X.isoelectric_point() 
    print X.secondary_structure_fraction()

这里有什么问题？糟糕的python设置？我真的不认为这是剧本.

(我意识到StackOverflow上有很多关于python相对导入的问题;我怀疑我这样做是错误的;但无论如何都要进行..)

我有一个python项目(mysubmod)组织如下:

/__init__.py
/lib
- /__init__py
- /foobar.py
/models
- /__init__.py
- /hello.py

重要的:

• /models/hello.py导入lib.foobar
• /models/hello.py有一个运行一些测试的主块

然后我有第二个项目(myproj),我已经将mysubmod作为git子模块导入其中; myproj现在组织如下 -

/mysubmod
/scripts
- /__init__.py
- /__test.py

哪里:

• scripts/test.py导入mysubmod.models.hello

但是,当我从命令行运行/scripts/test.py时,解释器现在抱怨mysubmod/models/hello.py无法再找到lib.foobar.

刷新.

更改了mysubmod/models/hello.py,因此它现在导入..lib.foobar

现在我可以毫无怨言地运行/scripts/test.py,但我不能再从命令行运行任何submod脚本作为文件; 我只能使用python -m选项将它们作为模块运行.

此外,我不能再单独运行submod项目文件,即使使用-m选项,因为解释器抱怨"尝试相对导入超出顶级包"; 我必须上一个目录级别,即只能从myproj根目录运行mysubmod(其中mysubmod作为根级别目录).

这一切似乎都令人不满意.我希望能够:

• 使用git子模块将mysubmod导入到myproj中,以便它"正常工作"
• 继续能够独立开发mysubmod(即将脚本作为文件而不是模块运行)

有没有人对如何做到这一点？关于git子模块和python的最佳实践的任何看法？

谢谢.

我在 Pycharm 中有一个 python 项目，其中有一个嵌套的 Git 子模块。这是文件夹结构：

my-git-repo
    git-submodule-repo
        package1
           foo.py
           bar.py
    package2
        baz.py
    .gitmodules

导入git-submodule-repo的结构如下：

foo.py:
from package1.bar import some_func

但是，Pycharm 不承认这一点，并希望我改为拥有以下内容：

foo.py:
from git-submodule-repo.package1.bar import some_func

这是有问题的，因为我不想更改所有导入git-submodule-repo（这似乎不是一个好的做法，而且不可扩展）并且其中git-submodule-repo有破折号，这对于导入来说不是有效的 Python 语法（我可以） t 重命名回购）。

我还需要一种从git-submodule-repo代码中导入的方法。像这样的东西：

baz.py:
from git-submodule-repo.package1.bar import some_func

但当然没有破折号使其语法无效。这是内容.gitmodules以防万一它有用：

[submodule "git-submodule-repo"]
    path = git-submodule-repo
    url = https://github.com/SomeAccount/git-submodule-repo.git

任何帮助，将不胜感激！