相关疑难解决方法(0)

Matplotlib似乎需要$ DISPLAY环境变量,这意味着正在运行的X服务器.
某些Web托管服务不允许运行X服务器会话.
有没有办法在没有正在运行的X服务器的情况下使用matplotlib生成图形？

[username@hostname ~]$ python2.6
Python 2.6.5 (r265:79063, Nov 23 2010, 02:02:03)
[GCC 4.1.2 20080704 (Red Hat 4.1.2-48)] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import matplotlib.pyplot as plt
>>> fig = plt.figure()
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/username/lib/python2.6/matplotlib-1.0.1-py2.6-linux-i686.egg/matplotlib/pyplot.py", line 270, in figure
    **kwargs)
  File "/home/username/lib/python2.6/matplotlib-1.0.1-py2.6-linux-i686.egg/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 80, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/local/lib/python2.6/lib-tk/Tkinter.py", line 1643, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, …

我正试图用命令在远程计算机上生成一个数字pylab.savefig.但我得到了这样的错误:

Unable to access the X Display, is $DISPLAY set properly?

如何正确保存图形？

我有一个python代码在远程机器上进行一些计算,名为A.我ssh从一台名为B的机器上连接A via .有没有办法在机器B上显示数字？

在远程计算机上使用Matplotlib时(例如在Travis CI上),我遇到了与未设置的DISPLAY环境变量相关的频繁运行时错误.按照建议,我在测试脚本的开头设置了Agg后端matplotlib.use,并确保没有调用show().不过,我仍然会遇到以下错误:

Traceback (most recent call last):
  File "/home/travis/anaconda/envs/testenv/lib/python2.7/site-packages/nose/case.py", line 197, in runTest
    self.test(*self.arg)
  File "/home/travis/build/pymc-devs/pymc/pymc/tests/test_plots.py", line 36, in test_multichain_plots
    forestplot(ptrace, vars=['early_mean', 'late_mean'])
  File "/home/travis/build/pymc-devs/pymc/pymc/plots.py", line 325, in forestplot
    interval_plot = subplot(gs[0])
  File "/home/travis/anaconda/envs/testenv/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/pyplot.py", line 896, in subplot
    fig = gcf()
  File "/home/travis/anaconda/envs/testenv/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/pyplot.py", line 450, in gcf
    return figure()
  File "/home/travis/anaconda/envs/testenv/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/pyplot.py", line 423, in figure
    **kwargs)
  File "/home/travis/anaconda/envs/testenv/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/backends/backend_qt4agg.py", line 31, in new_figure_manager
    return new_figure_manager_given_figure(num, thisFig)
  File "/home/travis/anaconda/envs/testenv/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/backends/backend_qt4agg.py", line 38, in new_figure_manager_given_figure
    canvas = FigureCanvasQTAgg(figure) …

I am trying to plot a simple graph using pyplot, e.g.:

import matplotlib.pyplot as plt
plt.plot([1,2,3],[5,7,4])
plt.show()

but the figure does not appear and I get the following message:

UserWarning: Matplotlib is currently using agg, which is a non-GUI backend, so cannot show the figure.

I saw in several places that one had to change the configuration of matplotlib using the following:

import matplotlib
matplotlib.use('TkAgg')
import matplotlib.pyplot as plt

I did this, but then got an error message because it …

我正在尝试运行一个非常简单的代码,在集群中输出.png文件.这是代码:

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

x = np.random.randn(60)
y = np.random.randn(60)

plt.scatter(x, y, s=20)

out_png = 'path/to/store/out_file.png'
plt.savefig(out_png, dpi=150)

如果我使用python simple_code.py安装了matplotlib 1.2.1的系统中的命令运行此代码,我会收到警告:

Unable to load library icui18n "Cannot load library icui18n:

.png图像仍然生成,所以我没有问题.但是如果我在安装了matplotlib 1.3.0的集群中使用相同的命令和代码,则会失败并显示错误:

Traceback (most recent call last):
  File "simple_code.py", line 33, in <module>
    plt.scatter(x, y, s=20)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 3078, in scatter
    ax = gca()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 803, in gca
    ax =  gcf().gca(**kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 450, in gcf
    return figure()
  File …

我试图在中央服务器上运行模拟(用python编写),当模拟完成后,通过连接到我的本地PC将保存的图形文件/保存的数据文件移动到我的本地PC.代码如下:

import matplotlib.pyplot as plt
import subprocess
import scipy.io
import os

#Save data file:
scipy.io.savemat(data_path + Filename_str, dict(A=board))

#Create / Save figure by using imshow (Heatmap)
p = plt.imshow(mean_map.T, cmap = plt.cm.gist_yarg_r, origin = 'lower',  extent = [0, phi, 0, Z], aspect='auto')
plt.savefig(figure_path + Filename_str + '-Homophily.pdf')

# Connect to my local host (arabian-knights) using ssh, and follow command.
ret = subprocess.call(['ssh', 'arabian-knights', 'mv Data/* /scratch/Data/'])
ret = subprocess.call(['ssh', 'arabian-knights', 'mv Figure/* /scratch/Figure/'])

我从本地计算机(阿拉伯骑士)连接到服务器计算机后,在服务器计算机的后台运行此模拟.即使我关闭与服务器计算机的连接,因为模拟在后台运行,它不会停止,并且模拟完成后数据文件正确地移动到我的本地计算机.但是,不保存图文件(由matplotlib.pyplot.imshow生成),显示以下错误消息:

Traceback (most recent call …

当尝试使用 Tkinter 标准库包或其相关功能（海龟图形使用turtle和内置 IDLE IDE）或使用将此作为依赖项的第三方库（例如显示使用 Matplotlib 的图形窗口）。

似乎即使不存在因隐藏标准库模块名称而引起的问题（对于尝试遵循教程并使用海龟图形的初学者来说，这是一个常见问题 -示例 1；示例 2；示例 3；示例 4），通常会发生标准库 Tkinter 无法工作的情况。这是一个大问题，因为许多初学者再次尝试遵循使用海龟图形的教程，并盲目地假设turtle标准库将会存在。

可能会报错：

• 作为ModuleNotFoundError: No module named 'tkinter'; 或ImportError具有相同消息的 ；或使用不同的大小写（我知道名称从Tkinter2.x 更改为tkinter3.x；这是一个不同的问题）。

• 类似地，但引用内部_tkinter模块，并显示带有注释的代码“如果失败，您的 Python 可能无法配置 Tk”；或者使用自定义错误消息“请安装 python-tk 包”或类似内容。

• 当尝试turtle专门使用时，出现“没有名为turtle的模块” ，或者上述错误之一。

• 当尝试使用 Matplotlib 显示绘图时；通常，这种情况会在尝试更改后端后发生，默认设置是为了避免尝试使用 Tkinter。

当 Tkinter 被记录为标准库的一部分时，为什么会出现这样的问题？如何添加或修复缺少的标准库功能？对于特定的 …