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编辑:哈德利威克姆指出我错过了.R CMD检查是投掷NOTES,而不是警告.我非常抱歉这种混乱.这是我的疏忽.

简短的版本

R CMD check每次我在ggplot2中使用合理的绘图创建语法时都会抛出此注释:

no visible binding for global variable [variable name]

我理解为什么R CMD检查会这样做,但它似乎将整个其他合理的语法定为犯罪.我不知道采取什么措施来让我的包裹通过R CMD check并获准进入CRAN.

的背景

Sascha Epskamp之前基本上发布了相同的问题.我认为,不同之处在于它的手册subset()页说它是专为交互式使用而设计的.

就我而言,问题还没有结束,subset()而是超出了一个核心特征ggplot2:data =争论.

我编写的代码示例生成这些注释

这里的一个子功能在我的包,增加了指向一个情节:

JitteredResponsesByContrast <- function (data) {
  return(
    geom_point(
             aes(
               x = x.values, 
               y = y.values
             ),
             data     = data,
             position = position_jitter(height = 0, width = GetDegreeOfJitter(jj))
    )
  )
}

R CMD …

我在Ubuntu 14上使用R 3.0.2.我在代码中进行了一些繁重的计算,并尝试了"编译器"包

compilePKGS(enable=TRUE)
enableJIT(3)

它似乎加快了我的代码.非常好!

但每次我的软件包启用"编译器"时,我都会收到很多笔记

Note: no visible binding for global variable '.Data'

或类似于我自己的S4对象(代码中的"obj @ result"):

Note: no visible binding for global variable 'result'

例如,它是自制S4对象的一部分.添加setCompilerOptions("suppressAll", TRUE)或setCompilerOptions("suppressUndefined", TRUE)没有帮助.当我完全停用编译器包时,根本不会弹出任何注释,所以这可能是我对compiler-package/jit的理解有问题？

我该怎么做来压制这些笔记？

编辑:

require(compiler)
compilePKGS(enable=TRUE)
enableJIT(3)



setClass(Class = "testobject", 
         slots = c( data     = "numeric",   
                    test     = "character", 
                    split    = "numeric",   
                    name     = "character"  
         )
)

a <- new("testobject", data=c(1,2,3,4), test="TEST", split=5, name="NAME")

for(i in a@data){
  print(i)
}

简单的例子产生

Note: no visible binding for global variable '.Data' 
Note: …