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如何加速Eigen库的矩阵产品?

我正在使用Eigen库研究两个大矩阵的简单乘法.对于相同大小的矩阵,此乘法似乎明显慢于Matlab和Python.

有没有什么可以使特征操作更快?

问题细节

X:随机1000 x 50000矩阵

Y:随机50000 x 300矩阵

计时实验(在我2011年末的Macbook Pro上)

使用Matlab:X*Y需要~1.3秒

使用Enthought Python:numpy.dot(X,Y)需要大约2.2秒

使用特征:X*Y需要~2.7秒

特征细节

你可以得到我的Eigen代码(作为MEX函数):https://gist.github.com/michaelchughes/4742878

该MEX函数从Matlab读入两个矩阵,并返回其产品.

在没有矩阵乘积运算的情况下运行这个MEX函数(即只是执行IO)会产生可忽略的开销,因此函数和Matlab之间的IO并不能解释性能上的巨大差异.这显然是实际的矩阵产品操作.

我用g ++编译,带有这些优化标志:" - O3 -DNDEBUG"

我正在使用最新的稳定Eigen头文件(3.1.2).

关于如何提高Eigen性能的任何建议?任何人都可以复制我看到的差距吗?

更新 编译器似乎真的很重要.最初的Eigen时序是使用Apple XCode的g ++版本完成的:llvm-g ++ - 4.2.

当我使用通过MacPorts下载的g ++ - 4.7(相同的CXXOPTIMFLAGS)时,我获得2.4秒而不是2.7秒.

关于如何更好地编译的任何其他建议将非常感激.

您还可以获得此实验的原始C++代码:https://gist.github.com/michaelchughes/4747789

./MatProdEigen 1000 50000 300

在g ++ - 4.7下报告2.4秒

matlab mex eigen

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