我有一个包含3列数据的.csv文件.我需要创建一个新的输出文件,其中包含原始文件中第一列和第三列的特定数据集.第三列包含十进制值,我相信在这种情况下我使用了python的float()功能.我试过以下代码:
in_file = open("filename.csv", "r")
out_file = open("output.csv", "w")
while True:
line = in_file.readline()
if (line == ''):
break
line = line.strip()
items = line.split(',')
gi_name = items[0]
if (gi_name.startswith("_"))
continue
p_value = float(items[2])
if (p_value > 0.05):
continue
out_file.write(','.join([gene_name, str(p_value)]))
in_file.close()
out_file.close()
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
当我运行上面的内容时,我收到以下错误:
错误:float()的文字无效:0.000001
值0.0000001是我的第三列数据集中的第一个值,我想代码不能读取超出该集合但我不确定原因.我是python的新手,并不真正理解为什么我收到此错误或如何解决它.我已经尝试了如何输入float()的其他修改,但没有成功.有谁知道我怎么能解决这个问题?
给出以下脚本来读取纬度,经度和幅度数据:
#!/usr/bin/env python
# Read in latitudes and longitudes
eq_data = open('lat_long')
lats, lons = [], []
for index, line in enumerate(eq_data.readlines()):
if index > 0:
lats.append(float(line.split(',')[0]))
lons.append(float(line.split(',')[1]))
#Build the basemap
from mpl_toolkits.basemap import Basemap
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
antmap = Basemap(projection='spstere', boundinglat=-20, lon_0=-60, resolution='f')
antmap.drawcoastlines(color='0.50', linewidth=0.25)
antmap.fillcontinents(color='0.95')
x,y = antmap(lons, lats)
antmap.plot(x,y, 'r^', markersize=4)
plt.show()
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
尝试阅读纬度,经度和幅度时,我收到以下错误:
Traceback (most recent call last):
File "./basic_eqplot.py", line 10, in <module>
lats.append(float(line.split(',')[0]))
ValueError: invalid literal for float(): -18.381 -172.320 …Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)