我正在尝试使用data.table来加速处理由几个较小的合并data.frames组成的大型data.frame(300k x 60).我是data.table的新手.到目前为止的代码如下
library(data.table)
a = data.table(index=1:5,a=rnorm(5,10),b=rnorm(5,10),z=rnorm(5,10))
b = data.table(index=6:10,a=rnorm(5,10),b=rnorm(5,10),c=rnorm(5,10),d=rnorm(5,10))
dt = merge(a,b,by=intersect(names(a),names(b)),all=T)
dt$category = sample(letters[1:3],10,replace=T)
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我想知道是否有比以下更有效的方法来总结数据.
summ = dt[i=T,j=list(a=sum(a,na.rm=T),b=sum(b,na.rm=T),c=sum(c,na.rm=T),
d=sum(d,na.rm=T),z=sum(z,na.rm=T)),by=category]
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我真的不想手工输入所有50列计算,而且eval(paste(...))
似乎很笨拙.
我看了下面的例子,但对我的需求似乎有点复杂.谢谢
我想在data.table中调用一个函数来计算一组汇总统计信息,如下所示:
summ.stats <- function(vec) {
list(
Min = min(vec),
Mean = mean(vec),
S.D. = sd(vec),
Median = median(vec),
Max = max(vec))
}
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我想把它j
称为data.table
:
DT <- data.table(a=c(1,2,3,1,2,3),b=c(1,4,3,2,1,4),c=c(2,3,4,5,2,1))
DT[, summ.stats(b), by=a]
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这很好,我得到:
a Min Mean S.D. Median Max
1: 1 1 1.5 0.7071068 1.5 2
2: 2 1 2.5 2.1213203 2.5 4
3: 3 3 3.5 0.7071068 3.5 4
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但我有兴趣将多个变量传递给summ.stats.例如:
DT[, summ.stats(b, c), by=a]
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我希望得到类似的东西:
a Var Min Mean S.D. Median Max
1: 1 b 1 1.5 0.7071068 …
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