我有一个R函数,它为散点图产生95%置信度椭圆.输出看起来像这样,每个椭圆(50行)默认为50个点:
[,1] [,2]
[1,] 0.097733810 0.044957994
[2,] 0.084433494 0.050337990
[3,] 0.069746783 0.054891438
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我想在ggplot2
散点图上为每个级别的一个名为'site'的因子叠加一些这样的省略号,由这个命令生成:
> plat1 <- ggplot(mapping=aes(shape=site, size=geom), shape=factor(site)); plat1 + geom_point(aes(x=PC1.1,y=PC2.1))
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这是在一个数据集上运行,调用dflat
如下所示:
site geom PC1.1 PC2.1 PC3.1 PC1.2 PC2.2
1 Buhlen 1259.5649 -0.0387975838 -0.022889782 0.01355317 0.008705276 0.02441577
2 Buhlen 653.6607 -0.0009398704 -0.013076251 0.02898955 -0.001345149 0.03133990
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结果很好,但是当我尝试添加椭圆时(假设这个网站叫做"Buhlen"):
> plat1 + geom_point(aes(x=PC1.1,y=PC2.1)) + geom_path(data=subset(dflat, site="Buhlen"),mapping=aes(x=ELLI(PC1.1,PC2.1)[,1],y=ELLI(PC1.1,PC2.1)[,2]))
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我收到一条错误消息: "Error in data.frame(x = c(0.0977338099339815, 0.0844334944904515, 0.0697467834016782, :
arguments imply differing number of rows: 50, 211
我过去曾设法解决这个问题,但我不记得怎么做了.似乎geom_path依赖于相同的点而不是绘制新的点.任何帮助,将不胜感激.