我有一个执行BLAST查询的脚本(bl2seq)
该脚本的工作方式如下:
获取序列a,序列b 将序列a写入filea 将序列b写入fileb 运行命令'bl2seq -i filea -j fileb -n blastn' 从STDOUT获取输出,解析 重复2000万次
程序bl2seq不支持管道.有没有办法做到这一点,避免写入/读取硬盘?
我正在使用Python BTW.
python unix shell perl bioinformatics
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unix ×1