转换16位图像的选项

0 tiff 16-bit 8-bit imagej

当我打开tiff格式的16位图像时,它会打开为黑色图像.16位tiff图像仅在程序ImageJ中打开; 但是,它不会在预览中打开.我想知道我现在的选择是以更简单的方式查看格式,而不是降低分辨率而不是打开ImageJ来查看它.我应该将其转换为8位格式,但是当格式从16位减少到8位时,我不会丢失数据吗?另外,我正在考虑将tiff图像转换为jpeg,但这会导致分辨率降低吗?

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ImageJ wiki的故障排除页面:

将12位,14位或16位图像加载到ImageJ而不进行自动缩放时,可能会出现此问题.在这种情况下,即使实际数据值通常跨越更小的范围,显示也会缩放到完整的16位范围(0 - 65535个强度值).例如,在12位摄像机上,最大可能的强度值为4095,但0映射为黑色,65535映射为白色,4095最终(线性)映射到非常深的灰色,几乎看不到人眼.

您可以通过单击图像▶调整▶亮度/对比度...并点击自动按钮来解决此问题.

您可以通过在图像上移动鼠标并查看主ImageJ窗口的状态栏区域中的像素探针输出来验证实际数据是否存在.

换句话说,您的图像实际上不太可能是全0值,而是显示范围可能未设置为与数据范围对齐.如果您的图像具有范围从67到520的强度值,但存储为16位图像(潜在值范围从0到65535),则默认显示范围也是0 =黑色,65535 =白色,以及介于两者之间的值线性缩放.所以这些值(57到520)都会出现在黑色附近.当您自动缩放时,它会重置显示范围以匹配数据范围,使值67及以下显示为黑色,值520及以上显示为白色,并且两者之间的所有内容均线性缩放.

如果使用Bio-Formats插件将图像导入ImageJ,则可以选中"自动缩放"选项以确保自动进行动态显示范围缩放.

至于是否转换为JPEG:JPEG是一种有损压缩格式,它有自己的问题.如果您要进行任何定量分析,我强烈建议不要转换为JPEG.有关更多详细信息,请参阅斐济维基关于JPEG的文章.

类似地,如果您只想在另一个应用程序中进行可视化,则转换为8位很好,但对下转换的图像执行定量分析通常是错误的.请注意,当ImageJ将16位图像转换为8位(使用"图像">"类型"菜单)时,它会"燃烧"您当前在"亮度/对比度"对话框中设置的任何显示范围映射,使表观像素值进入实际的 8位像素值.