用C++打开HDF5文件的更好方法

Question

我一直试图找到解决HDF5 C++绑定的一些缺点的方法.目前,我的代码中充斥着类似于以下内容的try/catch块:

H5::Exception::dontPrint();
H5::H5File *file = NULL;
try {
    file = new H5::H5File(fname.c_str(), H5F_ACC_RDWR);
} catch(H5::FileIException &file_exists_err) {
    file = new H5::H5File(fname.c_str(), H5F_ACC_TRUNC);
}

这不是必需的 - 我想要做的就是打开一个文件进行读/写访问,如果不存在,则创建它.另一个棘手的问题是创建一个嵌套组(例如"/ parent/group"),其中父组不一定存在.在Unix/Linux中,等效的是

mkdir -p parent/group

但是,在HDF5 C++绑定中,创建其父组不存在的组会引发异常.

出于这些原因,我有动力创建一个头文件来处理这些常见问题.我的第一个想法是简单地创建一组函数,例如,采用文件名和访问模式并返回H5 :: H5File对象,或者获取组名并返回组对象.我认为这不太理想,因为它使得使用此头文件的程序员在返回的对象上调用"delete",即使程序员从未在自己的代码中明确地调用"new".这似乎是要求内存泄漏.

因此,我的第二个想法是从H5 :: H5File和H5 :: H5Group创建一组派生类,其中构造函数在文件尚不存在时不会抛出异常,或者当组的父组尚不存在时.我对派生文件类的尝试如下:

namespace H5Utils {

class H5File : public H5::H5File {
public:
    H5File(std::string fname);
    ~H5File();
};

}

H5Utils::H5File::H5File(std::string fname)
try : H5::H5File(fname.c_str(), H5F_ACC_RDWR)
{
    std::cerr << "Opened existing file." << std::endl;
} catch(H5::FileIException &file_exists_err) {
    std::cerr << "File does not exist. Creating new file." << std::endl;
    H5::H5File(fname.c_str(), H5F_ACC_TRUNC);
}

H5Utils::H5File::~H5File() { }

我遇到的问题是双重的.首先,构造函数中的try/catch块重新抛出由此创建的异常

H5::H5File(fname.c_str(), H5F_ACC_RDWR)

当文件不存在时,程序仍然终止.第二个问题是我不确定第二个构造函数,

H5::H5File(fname.c_str(), H5F_ACC_TRUNC);

是否正确(即它是否构造父类？)是否有办法让派生类在基类的构造函数中捕获异常,然后为基类调用不同的构造函数？

更一般地说,任何人都可以想到更好/更优雅的方式来处理HDF5 C++绑定的这些缺点吗？

Answer 1

我更喜欢你最初创建一些简单的辅助函数的想法 - 它会更简单,并最大限度地减少你必须编写和编写的代码量.此外,为了确保正确的内存管理,您可以使用shared_ptr.

这是一个简单的包装函数,等同于您的初始示例:

// a typedef for our managed H5File pointer
typedef std::shared_ptr<H5::H5File> H5FilePtr;

// create or open a file
H5FilePtr create_or_open(const std::string& fname)
{
    H5::Exception::dontPrint();
    H5::H5File* file = 0;

    try {
        file = new H5::H5File(fname.c_str(), H5F_ACC_RDWR);
    } catch(const H5::FileIException&) {
        file = new H5::H5File(fname.c_str(), H5F_ACC_TRUNC);
    }

    return H5FilePtr(file);
}