是否有良好的库可以快速进行非负矩阵分解(NMF)？

Question

我有一个稀疏矩阵,其形状为570000*3000.我试图尼玛做NMF(使用默认的NMF方法,并设定max_iter至65岁).但是,我发现nimfa很慢.有人用更快的库来做NMF吗？

Answer 1

我以前用过libNMF.它是用C语言编写的,速度非常快.有一篇文件记录了算法和代码.

本文还列出了NMF的几种替代软件包(以不同语言的形式(我在此复制以供将来参考).

• Mathworks [3,33]
  • MATLAB
  • http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/stats/nnmf.
• Cemgil [5]
  • MATLAB
  • http://www.cmpe.boun.edu.tr/~cemgil/bnmf
• Cichocki等.[6]
  • MATLAB
  • http://www.bsp.brain.riken.jp/ICALAB/nmflab.
• Cichocki等.[7]
  • MATLAB
  • http://eu.wiley.com/WileyCDA/WileyTitle/productCd-0470746661.html
• 汉森等人.[14]
  • MATLAB
  • http://isp.imm.dtu.dk/toolbox/nmf/index.html
• 霍耶[16]
  • MATLAB
  • http://www.cs.helsinki.fi/u/phoyer/software.html
• Kim等人.[19]
  • MATLAB
  • http://userweb.cs.utexas.edu/users/dmkim/Source/software/nnma/index.html
• 林[25]
  • 基于Matlab/Python的
  • http://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/nmf/index.html
• 施密特等人.[30]
  • MATLAB
  • http://mikkelschmidt.dk/index.php?id=2
• Gaujoux [10]
  • [R
  • http://cran.r-project.org/web/packages/NMF/index.html
• 刘[26]
  • [R
  • http://cran.r-project.org/web/packages/NMFN/index.html
• Battenberg等人.2
  • 蟒蛇
  • http://www.eecs.berkeley.edu/~ericb
• 施密特等人.[31]
  • 蟒蛇
  • http://www.procoders.net/?p=409
• Dhillon等.[8]
  • C++
  • http://www.kyb.mpg.de/bs/people/suvrit/work/progs/nnma.html
• Greene等人.[13]
  • C++
  • http://mlg.ucd.ie/nmf
• Pathak等人.[28]
  • C++
  • http://www.insight-journal.org/browse/publication/152
• 王等人.[34]
  • C++
  • http://www.biomedcentral.com/1471-2105/7/175

免责声明:我没有尝试过任何其他这些软件包(除了MATLAB之外).