在你的eclipse启动脚本或.profile(或任何地方)添加export GIT_SSH=/usr/bin/ssh之前启动eclipse.然后eclipse使用默认的ssh,它使用ssh代理,即使你的密钥在智能卡上,你也可以在eclipse中运行pull和push命令.
编辑:GIT_SSH由eclipse的egit解释,但也由独立的git解释.将其设置为/usr/bin/ssh将其设置为独立git的默认值,因此只有egit才会改变它的行为.
2016年6月更新（4年后）：Gunnar Wagenknecht现在在评论中提及：
现在可以在带有项目，Eclipse ssh-agent和Pageant支持的Eclipse Neon中使用
eclipseguru/eclipse-jsch-agent-proxy。
较早的Eclipse版本的一种解决方法是通过设置GIT_SSH环境变量来使用本机OS SSH客户端而不是Eclipse内置客户端：
export GIT_SSH=/usr/bin/ssh
（请参阅EGit SSH配置和EGit FAQ，SSH配置）
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