使用带有NA-continaing数据的ggpairs

Question

ggpairs在GGally包中看起来非常有用,但是当NA数据集中的任何地方存在时它似乎失败:

#require(GGally)
data(tips, package="reshape")
pm <- ggpairs(tips[,1:3]) #works just fine

#introduce NA
tips[1,1] <- NA
ggpairs(tips[,1:3])
> Error in if (lims[1] > lims[2]) { : missing value where TRUE/FALSE needed

我没有看到任何处理NA值的文档,并且ggpairs(tips[,1:3], na.rm=TRUE)(不出所料)解决方案不会更改错误消息.

我有一个数据集,其中可能有10%的值NA随机分散在整个数据集中.因此na.omit(myDataSet)将删除大部分数据.有没有办法解决？

Answer 1

GGally类似的一些函数ggparcoord()支持通过missing=[exclude,mean,median,min10,random]参数处理 NA。然而不幸的是，情况并非如此ggpairs()。

您可以做的就是用对数据的良好估计来替换 NA，您期望它ggpair()会自动为您完成。有一些很好的解决方案，例如用行均值、零、中位数甚至最近点替换它们（注意最近句子单词上的 4 个超链接！）。