使用mlab在mayavi中用文本注释许多点

Question

我正在尝试使用mayavi.mlab注释使用points3d()函数绘制的点.每个点都与一个标签相关联,我希望使用text3d()函数在点旁边绘制标签.绘制点很快,但是mlab.text3d()函数似乎不接受坐标数组,所以我必须循环遍历点并单独绘制文本,这非常慢:

        for i in xrange(0, self.n_labels):
            self.mlab_data.append(
                mlab.points3d( pX[self.labels == self.u_labels[i], 0],
                               pX[self.labels == self.u_labels[i], 1],
                               pX[self.labels == self.u_labels[i], 2],
                               color=self.colours[i],
                               opacity=1,
                               scale_mode="none",
                               scale_factor=sf ) )

            idcs, = np.where(self.labels == self.u_labels[i])
            for n in idcs.flatten():
                mlab.text3d( pX[n, 0],
                             pX[n, 1],
                             pX[n, 2],
                             "%d" % self.u_labels[i],
                             color=self.colours[i],
                             opacity=1,
                             scale=sf )

我有什么想法可以加快速度吗？此外,是否可以添加图例(例如在matplotlib中),我在文档中找不到任何内容.

谢谢,

帕特里克

Answer 1

您在上面执行此操作的方式将在每次绘制点或文本时渲染场景.这很慢.您可以禁用场景渲染,进行绘图,然后通过figure.scene.disable_render = True/False渲染场景:

    import scipy
    from mayavi import mlab

    X = 100 * scipy.rand(100, 3)
    figure = mlab.figure('myfig')
    figure.scene.disable_render = True # Super duper trick
    mlab.points3d(X[:,0], X[:,1], X[:,2], scale_factor=0.4)
    for i, x in enumerate(X):
        mlab.text3d(x[0], x[1], x[2], str(i), scale=(2, 2, 2))
    figure.scene.disable_render = False # Super duper trick

我使用这个技巧和图形类中的其他形态在形态查看器https://github.com/duanemalcolm/morphic/blob/master/morphic/viewer.py

代码中的另一个好方法是重用现有对象,即,如果您已经绘制了文本,请不要重新绘制它们,只需更新它们的位置和文本属性.这意味着保存mlab对象.你可以在morphic.Viewer中看到我是如何做到这一点的.