序列1.1.1 ATGCGCGCGATAAGGCGCTA
ATATTATAGCGCGCGCGCGGATATATATATATATATATT
序列1.2.2 ATATGCGCGCGCGCGCGGCC
ACCCCGCGCGCGCGCGGCGCGATATATATATATATATATT
序列2.1.1 ATTCGCGCGAGTATAGCGGCG
现在,我想删除以'>'开头的每一行的最后一位数字.例如,在第一行中,我想删除'.1'(最右边),在第二行中,我想删除'.2',然后将文件的其余部分写入新文件.谢谢,
import fileinput
import re
for line in fileinput.input(inplace=True, backup='.bak'):
line = line.rstrip()
if line.startswith('>'):
line = re.sub(r'\.\d$', '', line)
print line
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
许多细节可以根据您想要的处理细节进行更改,但您没有明确表达,但这是一般性的想法.
| 归档时间: |
|
| 查看次数: |
329 次 |
| 最近记录: |