plot.new()中的错误:R中的数字边距太大

Question

我是R的新手,但是我已经制作了许多具有较小数据集的相关图.但是,当我尝试绘制一个大型数据集(2gb +)时,我可以很好地生成绘图,但图例不会显示.有什么建议？还是替代品？

library(gplots)
r.cor <- cor(r)
layout(matrix(c(1,1,1,1,1,1,1,1,2,2), 5, 2, byrow = TRUE))
par(oma=c(5,7,1,1))
cx <- rev(colorpanel(25,"yellow","black","blue"))
leg <- seq(min(r.cor,na.rm=T),max(r.cor,na.rm=T),length=10)
image(r.cor,main="Correlation plot Normal/Tumor data",axes=F,col=cx)
axis(1, at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]], 
    cex.axis=0.9,las=2)
axis(2,at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]],
     cex.axis=0.9,las=2)
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)     

错误plot.new():图边距太大

tmp <- round(leg,2)
axis(1,at=seq(0,1,length=length(leg)), labels=tmp,cex.axis=1)

Answer 1

Rstudio中可能会发生此错误,因为您的"Plots"窗格只是太小了.尝试缩放"文件,图,包,帮助,查看器",看看它是否有帮助!

Answer 2

我怀疑问题是你的layout()调用创建的小数字区域2 不够大,只能包含默认边距,更不用说情节了.

在导致问题的行之前尝试:

par(mar = rep(2, 4))

然后绘制第二个图像

image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)

你需要在par()我展示的电话中使用边距的大小才能做到这一点.您可能还需要增加要绘制的实际设备的大小.

最后一个提示,par()在更改之前保存默认值,因此将现有par()调用更改为:

op <- par(oma=c(5,7,1,1))

然后在绘图结束时做

par(op)

Answer 3

如果你在RStudio中收到这条消息,点击Plots选项卡中的'broomstick'图"Clear All Plots",再次尝试plot()可能会有效.

Answer 4

这有时会发生在RStudio中.为了解决这个问题,您可以尝试绘制到外部窗口(仅限Windows):

windows() ## create window to plot your file
## ... your plotting code here ...
dev.off() 

Answer 5

我在R Studio中遇到了这个错误,只需通过点击并从右向左拖动边栏使侧边栏更大来修复.

Answer 6

检查您的对象是列表还是向量.为此,请键入is.list(yourobject).如果是这样,请尝试重命名x<-unlist(yourobject).这将使它成为你可以绘制的矢量.

Answer 7

如果您使用RStudio,只需缩放此区域.