加载工作区时出现"错误的幻数"错误以及如何避免错误？

Question

我试图加载我的R工作区并收到此错误:

Error: bad restore file magic number (file may be corrupted) -- no data loaded
In addition: Warning message:
file ‘WORKSPACE_Wedding_Weekend_September’ has magic number '#gets'
   Use of save versions prior to 2 is deprecated 

我对技术细节并不特别感兴趣,但主要是我如何引起它以及如何在将来阻止它.以下是有关情况的一些注意事项:

1. 我在一个在训练营分区上运行Windows XP的MacBook Pro上运行R 2.15.1.
2. 这个工作区文件有明显的错误,因为它的重量只有~80kb,而我的其他文件通常都超过10,000
3. 在周末,我在R中运行外部建模程序并将其输出存储到不同的对象.我在几天的过程中运行了几次模型迭代,例如output_Saturday < - call_model()
4. 模型输出没有什么特别之处,它只是一个包含beta用于插槽,VC矩阵,模型规范等的列表.

Answer 1

当我意外地使用load()而不是source()或时,我得到了那个错误readRDS().

Answer 2

假设您的文件名为"myfile.ext"

如果您尝试加载的文件不是您要使用的R脚本

source("myfile.ext")

您可以尝试该readRDS函数并将其分配给变量名:

my.data <- readRDS("myfile.ext")

Answer 3

同样值得一提的是，R核心团队从文档中总结了v3.5.0之后的R版本的更改（此处）：

R具有新的序列化格式（版本3），该格式支持ALTREP框架对象的自定义序列化... 格式3的序列化数据不能被3.5.0之前的R版本读取。

在v3.6.0中保存工作区，然后与使用v3.4.2的同事共享文件时遇到了此问题。通过将“ version = 2”添加到我的保存函数中，我能够解决此问题。

Answer 4

当您尝试使用load()rds 对象而不是使用时也会发生这种情况

object <- readRDS("object.rds")

Answer 5

神奇的数字来自UNIX类型的系统,其中文件的前几个字节持有指示文件类型的标记.

此错误表示您正在尝试将无效的文件类型加载到R中.出于某种原因,R不再将此文件识别为R工作区文件.

Answer 6

安装readr包，然后使用library(readr).

Answer 7

saveRDS()我在使用而不是保存时收到错误save()。例如save(iris, file="data/iris.RData")

这为我解决了这个问题。我在这里找到了这个信息

另请注意，使用save()/ 时load()，对象会使用与最初保存时相同的名称加载（即，在它已经以最初保存时的名称加载到 R 环境中之前，您无法重命名它）。