如何让R读取我的环境变量？

Question

我在EC2现场实例上运行R,我需要R来终止实例并在脚本运行后取消现场请求.

为此,我已将"请求ID"设置为环境变量/.bashrc,我的计划是在脚本准备好后简单地将以下代码调用到R中

system("ec2-cancel-spot-instance-requests $SIR")

我遇到的问题是R没有"看到"我env从外部R 键入时看到的相同环境变量,因此命令不起作用.

我已经检查过,如果我在/etc/environmentR 处设置我的环境变量就能看到这些变量,但这是另一个问题.由于这些变量是动态的(每次创建专色实例时实例ID和请求ID都不同),我运行的脚本以下列形式创建它们:

export SIR=`cat /etc/ec2_instance_spot_id.txt`

该文件包含动态ID的位置

那么,我如何将"动态"环境变量插入/etc/environment？或者,我如何让R读取环境变量/.bashrc？

任何正确方向的提示将非常感谢!

Answer 1

你想Sys.getenv()在Sys.getenv("PATH"),说.

或者为你的例子,试试吧

SIR <- Sys.getenv("SIR")   
system(paste("ec2-cancel-spot-instance-requests",  SIR))

至于在启动时设置变量,请参阅help(Startup)了解~/.Renvironment等

我使用`Sys.setenv()`完成了这项工作,并基本上将我的环境变量从外部R复制到R.虽然这使我的脚本工作,但我希望我能理解为什么有一整套不同的环境变量使用R (4认同)
非常感谢德克抽出宝贵的时间。我遇到的问题是，当我执行例如 `names(s <- Sys.getenv())` 时，则 `SIR` 不存在，当我执行 `SIR <- Sys.getenv("SIR")` 时SIR 中什么都没有，但是当我退出 R 并执行“env”时，环境变量列表与我在“Sys.getenv()”时得到的环境变量列表完全不同，在那里我可以看到 SIR 和我需要的其他变量。我会看看“Renvironment”，再次非常感谢。 (3认同)