更新现有的Rdata文件

Question

我发现自己处于需要更新之前使用的Rdata文件中的一个或两个数据对象的位置save.如果我不小心加载文件,我可能会忘记在文件中重新保存一些对象.作为一个例子,我正在处理一个存储有一些对象的包sysdata.rda(用于内部使用的查找表,我不想导出),只想担心更新单个对象.

如果有一种标准的方法可以做到这一点,我还没有成功,所以创建了我自己的功能.

resave <- function (..., list = character(), file = stop("'file' must be specified")) {
  # create a staging environment to load the existing R objects
  stage <- new.env()
  load(file, envir=stage)
  # get the list of objects to be "resaved"
  names <- as.character(substitute(list(...)))[-1L]
  list <- c(list, names)
  # copy the objects to the staging environment
  lapply(list, function(obj) assign(obj, get(obj), stage))
  # save everything in the staging environment
  save(list=ls(stage, all.names=TRUE), file=file)
}

虽然看起来有点矫枉过正.有没有更好/更简单的方法来做到这一点？

顺便说一下,我是否正确地假设在函数调用之后在函数范围内创建的新环境被销毁？

Answer 1

这是一个稍短的版本:

resave <- function(..., list = character(), file) {
   previous  <- load(file)
   var.names <- c(list, as.character(substitute(list(...)))[-1L])
   for (var in var.names) assign(var, get(var, envir = parent.frame()))
   save(list = unique(c(previous, var.names)), file = file)
}

我利用了load函数返回已加载变量的名称这一事实,因此我可以使用函数的环境而不是创建一个.在使用时get,我小心翼翼地只查看调用函数的环境,即parent.frame().

这是一个模拟:

x1 <- 1
x2 <- 2
x3 <- 3
save(x1, x2, x3, file = "abc.RData")

x1 <- 10
x2 <- 20
x3 <- 30
resave(x1, x3, file = "abc.RData")

load("abc.RData")
x1
# [1] 10
x2
# [1] 2
x3
# [1] 30