randomForest的重要性仅包含MeanDecreaseGini

Question

我有两个脚本都在R中生成随机森林，据我所知，它们具有相同的输入，尽管我的问题表明情况并非如此。其中一个返回包含以下内容的重要性表

row.names importance.blue importance.red importance.MeanDecreaseAccuracy importance.MeanDecreaseGini

其他重要性表仅包含

row.names   MeanDecreaseGini

这两个森林之间的区别是什么？更重要的是，鉴于我认为相同的输入，是什么引起了差异？

（脚本太大了，无法在此处粘贴，但是两个脚本都试图根据一系列连续变量来预测一个因素）

Answer 1

randomForest的帮助页面告诉我们，重要性（当用于分类时）是一个nclass + 2列的矩阵。前nclass列是针对特定类别的度量，计算为准确性的平均下降。nclass + 1st列是所有类的准确性平均下降。最后一栏是基尼系数的平均下降。如果重要性=假，则最后一个度量仍作为向量返回。

因此，在我看来，您一次调用了randomForest，其重要性为TRUE，而重要性为FALSE。