ala*_*lan 48 r time-series sliding-window data.table
使用data.table包实现滑动窗口函数的最佳(最快)方法是什么?
我正在尝试计算滚动中位数但每个日期有多行(由于2个额外的因素),我认为这意味着动物园rollapply函数不起作用.以下是使用naive for循环的示例:
library(data.table)
df <- data.frame(
id=30000,
date=rep(as.IDate(as.IDate("2012-01-01")+0:29, origin="1970-01-01"), each=1000),
factor1=rep(1:5, each=200),
factor2=1:5,
value=rnorm(30, 100, 10)
)
dt = data.table(df)
setkeyv(dt, c("date", "factor1", "factor2"))
get_window <- function(date, factor1, factor2) {
criteria <- data.table(
date=as.IDate((date - 7):(date - 1), origin="1970-01-01"),
factor1=as.integer(factor1),
factor2=as.integer(factor2)
)
return(dt[criteria][, value])
}
output <- data.table(unique(dt[, list(date, factor1, factor2)]))[, window_median:=as.numeric(NA)]
for(i in nrow(output):1) {
print(i)
output[i, window_median:=median(get_window(date, factor1, factor2))]
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
data.table目前,滚动窗口没有任何特殊功能.我在这里回答另一个类似问题的进一步细节:
滚动中位数很有意思.它需要一个专门的功能才能有效地完成(与早期评论中的链接相同):
data.table这里的问题和答案中的解决方案相对于适当的专门rollingmedian功能(R afaik不可用)都是非常低效的.