使用pip安装SciPy和NumPy

Question

我正在尝试在我正在分发的包中创建所需的库.它需要SciPy和NumPy库.在开发过程中,我安装了两个

apt-get install scipy

安装了SciPy 0.9.0和NumPy 1.5.1,它运行良好.

我想使用相同的方法pip install- 以便能够在我自己的包的setup.py中指定依赖项.

问题是,当我尝试:

pip install 'numpy==1.5.1'

它工作正常.

但是之后

pip install 'scipy==0.9.0'

惨遭失败

raise self.notfounderror(self.notfounderror.__doc__)

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError:

Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.

Directories to search for the libraries can be specified in the

numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting

the BLAS environment variable.

我如何让它工作？

Answer 1

这在Ubuntu 14.04上对我有用:

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev gfortran
pip install scipy

Answer 2

如果您使用的是Ubuntu,则需要libblas和liblapack开发包.

aptitude install libblas-dev liblapack-dev
pip install scipy

Answer 3

我在答案中假设Linux经验; 我发现有三个先决条件可以pip install scipy很好地进行.

转到此处:安装SciPY

按照说明下载,构建和导出BLAS的env变量,然后是LAPACK.小心不要盲目地切断'n'粘贴shell命令 - 根据你的体系结构等,你需要选择几行,你需要修复/添加它错误地假定的正确目录.好.

您可能需要的第三件事是yum install numpy-f2py或等效的.

哦,是的,最后,您可能需要安装gcc-gfortran,因为上面的库是Fortran源代码.

Answer 4

由于之前关于使用yum安装的说明已经破坏,因此更新了有关像fedora这样的安装的说明.我在"亚马逊Linux AMI 2016.03"上测试了这个

sudo yum install atlas-devel lapack-devel blas-devel libgfortran
pip install scipy

Answer 5

我正在开发一个依赖于numpy和scipy的项目.在Fedora 23的干净安装中,使用Python 3.4的python虚拟环境(也适用于Python 2.7),以及我的setup.py中的以下内容(在setup()方法中)

setup_requires=[
    'numpy',
],
install_requires=[
    'numpy',
    'scipy',
],

我发现我必须运行以下内容才能开始pip install -e .工作:

pip install --upgrade pip

和

sudo dnf install atlas-devel gcc-{c++,gfortran} subversion redhat-rpm-config

这redhat-rpm-config是为了scipy的使用而redhat-hardened-cc1不是常规cc1