在matplotlib中动态更新绘图

Sha*_*wer 101 python tkinter matplotlib

我在Python中创建一个应用程序,它从串行端口收集数据,并根据到达时间绘制收集数据的图表.数据的到达时间不确定.我希望在收到数据时更新绘图.我搜索了如何做到这一点,并找到了两种方法:

  1. 清除绘图并再次绘制所有点的绘图.
  2. 通过在特定间隔后更改它来为动画设置动画.

我不喜欢第一个,因为程序运行并收集数据很长一段时间(例如一天),重绘绘图将非常慢.第二个也不是优选的,因为数据的到达时间是不确定的,并且我希望仅在接收到数据时更新图.

有没有办法只通过在收到数据时添加更多的点来更新图表?

Chr*_*ris 121

有没有办法我可以通过添加更多的点[s]来更新图表...

在matplotlib中有很多种动画数据的方法,具体取决于您拥有的版本.你看过matplotlib食谱的例子吗?另外,请查看matplotlib文档中更现代的动画示例.最后,动画API定义了一个函数FuncAnimation,它可以及时激活一个函数.此功能可能只是您用于获取数据的功能.

每种方法基本上都设置了data绘制对象的属性,因此不需要清除屏幕或图形.该data属性可以简单地扩展,因此您可以保留以前的点,并继续添加到您的线(或图像或您正在绘制的任何内容).

鉴于您说您的数据到达时间不确定,您最好的选择可能只是做以下事情:

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy

hl, = plt.plot([], [])

def update_line(hl, new_data):
    hl.set_xdata(numpy.append(hl.get_xdata(), new_data))
    hl.set_ydata(numpy.append(hl.get_ydata(), new_data))
    plt.draw()
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

然后,当您从串口接收数据时,只需调用即可update_line.

  • 由于没有调用show(),因此绘图永远不会出现在屏幕上.如果我调用show(),它会阻止并且不执行更新.我错过了什么吗?https://gist.github.com/daviddoria/027b5c158b6f200527a4 (21认同)
  • 找到答案:在更新数据之后但在调用plt.draw()之前调用ax.relim()然后调用ax.autoscale_view() (12认同)
  • [链接到一个类似但不同的*自包含*答案,你可以运行的代码](http://stackoverflow.com/a/4098938/52074)(这个答案有正确的一般想法,但示例代码不能运行) (2认同)

Zah*_*Zah 33

为了在没有FuncAnimation的情况下执行此操作(例如,您希望在生成绘图时执行代码的其他部分,或者您希望同时更新多个绘图),draw单独调用不会产生绘图(至少使用qt后端).

以下适用于我:

import matplotlib.pyplot as plt
plt.ion()
class DynamicUpdate():
    #Suppose we know the x range
    min_x = 0
    max_x = 10

    def on_launch(self):
        #Set up plot
        self.figure, self.ax = plt.subplots()
        self.lines, = self.ax.plot([],[], 'o')
        #Autoscale on unknown axis and known lims on the other
        self.ax.set_autoscaley_on(True)
        self.ax.set_xlim(self.min_x, self.max_x)
        #Other stuff
        self.ax.grid()
        ...

    def on_running(self, xdata, ydata):
        #Update data (with the new _and_ the old points)
        self.lines.set_xdata(xdata)
        self.lines.set_ydata(ydata)
        #Need both of these in order to rescale
        self.ax.relim()
        self.ax.autoscale_view()
        #We need to draw *and* flush
        self.figure.canvas.draw()
        self.figure.canvas.flush_events()

    #Example
    def __call__(self):
        import numpy as np
        import time
        self.on_launch()
        xdata = []
        ydata = []
        for x in np.arange(0,10,0.5):
            xdata.append(x)
            ydata.append(np.exp(-x**2)+10*np.exp(-(x-7)**2))
            self.on_running(xdata, ydata)
            time.sleep(1)
        return xdata, ydata

d = DynamicUpdate()
d()
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  • 要在 **Jupyter Notebook** 中使用它,您必须在 matplotlib import 语句之后添加 `%matplotlib notebook` 魔术命令。 (4认同)
  • 是的!终于有一个可以与 Spyder 配合使用的解决方案了!我缺少的是在draw()命令之后的gcf().canvas.flush_events()。 (2认同)

Gui*_*e S 5

我知道我迟到了回答这个问题,但对于你的问题,你可以查看“操纵杆”包。我设计它是为了绘制来自串行端口的数据流,但它适用于任何流。它还允许交互式文本记录或图像绘制(除了图形绘制之外)。无需在单独的线程中执行自己的循环,该包会处理它,只需给出您希望的更新频率即可。另外,终端在绘图时仍然可用于监控命令。请参阅http://www.github.com/ceyzeriat/joystick/https://pypi.python.org/pypi/joystick (use pip install joystick to install)

只需将以下代码中的 np.random.random() 替换为从串口读取的真实数据点即可:

import joystick as jk
import numpy as np
import time

class test(jk.Joystick):
    # initialize the infinite loop decorator
    _infinite_loop = jk.deco_infinite_loop()

    def _init(self, *args, **kwargs):
        """
        Function called at initialization, see the doc
        """
        self._t0 = time.time()  # initialize time
        self.xdata = np.array([self._t0])  # time x-axis
        self.ydata = np.array([0.0])  # fake data y-axis
        # create a graph frame
        self.mygraph = self.add_frame(jk.Graph(name="test", size=(500, 500), pos=(50, 50), fmt="go-", xnpts=10000, xnptsmax=10000, xylim=(None, None, 0, 1)))

    @_infinite_loop(wait_time=0.2)
    def _generate_data(self):  # function looped every 0.2 second to read or produce data
        """
        Loop starting with the simulation start, getting data and
    pushing it to the graph every 0.2 seconds
        """
        # concatenate data on the time x-axis
        self.xdata = jk.core.add_datapoint(self.xdata, time.time(), xnptsmax=self.mygraph.xnptsmax)
        # concatenate data on the fake data y-axis
        self.ydata = jk.core.add_datapoint(self.ydata, np.random.random(), xnptsmax=self.mygraph.xnptsmax)
        self.mygraph.set_xydata(t, self.ydata)

t = test()
t.start()
t.stop()
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NDM*_*NDM 5

这是一种允许在绘制一定数量的点后删除点的方法:

import matplotlib.pyplot as plt
# generate axes object
ax = plt.axes()

# set limits
plt.xlim(0,10) 
plt.ylim(0,10)

for i in range(10):        
     # add something to axes    
     ax.scatter([i], [i]) 
     ax.plot([i], [i+1], 'rx')

     # draw the plot
     plt.draw() 
     plt.pause(0.01) #is necessary for the plot to update for some reason

     # start removing points if you don't want all shown
     if i>2:
         ax.lines[0].remove()
         ax.collections[0].remove()
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