叠加了geom_map的ggmap

Question

library(sp)
library(spdep)
library(ggplot2)
library(ggmap)
library(rgdal)

获取并摆弄数据:

nc.sids <- readShapePoly(system.file("etc/shapes/sids.shp", package="spdep")[1],ID="FIPSNO", proj4string=CRS("+proj=longlat +ellps=clrk66"))
nc.sids=spTransform(nc.sids,CRS("+init=epsg:4326"))

从stamen.com获取背景地图,情节,看起来不错:

ncmap = get_map(location=as.vector(bbox(nc.sids)),source="stamen",maptype="toner",zoom=7)
ggmap(ncmap)

在地图上创建一个包含长,纬度,Z和绘图的数据框和一个空白图:

ncP = data.frame(coordinates(nc.sids),runif(nrow(nc.sids)))
colnames(ncP)=c("long","lat","Z")

ggmap(ncmap)+geom_point(aes(x=long,y=lat,col=Z),data=ncP)
ggplot()+geom_point(aes(x=long,y=lat,col=Z),data=ncP)

给它一些叫做'id'和强化的独特的id(用维生素和铁？)

nc.sids@data[,1]=1:nrow(nc.sids)
names(nc.sids)[1]="id"
ncFort = fortify(nc.sids)

现在,我的地图和我的极限,我想绘制74出生率:

myMap = geom_map(aes(fill=BIR74,map_id=id),map=ncFort,data=nc.sids@data)
Limits = expand_limits(x=ncFort$long,y=ncFort$lat)

在一个空白的情节我可以:

ggplot() + myMap + Limits

但在ggmap上我不能:

ggmap(ncmap) + myMap + Limits
# Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'lon' not found

一些版本:

> packageDescription("ggplot2")$Version
[1] "0.9.0"
> packageDescription("ggmap")$Version
[1] "2.0"

我可以将geom_polygon添加到ggplot或ggmap,它可以按预期工作.所以geom_map就好了....

Answer 1

我认为错误消息是继承问题的结果.通常,它是在后续层中使用不同数据帧时实现的.

在ggplot2中,每个层都继承了在初始调用中全局设置的默认aes映射ggplot.例如,ggplot(data = data, aes(x = x, y = y))全局设置x和y映射,以便所有后续层都可以查看x并y在任何数据帧中分配给它们.如果x和y不存在,则会出现与您获得的错误消息类似的错误消息.请参阅此处了解类似问题和一系列解决方案.

在你的情况下,它并不明显,因为第一个调用是ggmap- 你无法看到映射,也没有设置它们,因为它们完全ggmap被包裹起来.然而,在某处ggmap调用ggplot,因此默认的美学映射必须在初始调用中设置ggmap.接下来,ggmap在geom_map没有考虑继承问题的情况下导致错误.

因此,Kohske在之前的帖子中的建议适用 - "当你使用不同的数据集时,你需要使geom_map中的lon aes无效".如果不太了解已经设置的内容或者它们是如何设置的,那么通过添加inherit.aes = FALSE到第二层 - 调用来实现这一点可能是最简单的geom_map.

请注意,您没有收到错误消息,ggplot() + myMap + Limits因为ggplot调用中没有设置美学.

在下文中,我使用的是R版本2.15.0,ggplot2版本0.9.1和ggmap版本2.1.我几乎完全使用你的代码,除了inherit.aes = FALSE在调用中添加geom_map.一个小的变化允许ggmap和geom_map叠加:

library(sp)
library(spdep)
library(ggplot2)
library(ggmap)
library(rgdal)

#Get and fiddle with data:
nc.sids <- readShapePoly(system.file("etc/shapes/sids.shp", package="spdep")[1],ID="FIPSNO", proj4string=CRS("+proj=longlat +ellps=clrk66"))
nc.sids=spTransform(nc.sids,CRS("+init=epsg:4326"))

#Get background map from stamen.com, plot, looks nice:
ncmap = get_map(location=as.vector(bbox(nc.sids)),source="stamen",maptype="toner",zoom=7)
ggmap(ncmap)

#Create a data frame with long,lat,Z, and plot over the map and a blank plot:
ncP = data.frame(coordinates(nc.sids),runif(nrow(nc.sids)))
colnames(ncP)=c("long","lat","Z")

ggmap(ncmap)+geom_point(aes(x=long,y=lat,col=Z),data=ncP)
ggplot()+geom_point(aes(x=long,y=lat,col=Z),data=ncP)

#give it some unique ids called 'id' and fortify (with vitamins and iron?)
nc.sids@data[,1]=1:nrow(nc.sids)
names(nc.sids)[1]="id"
ncFort = fortify(nc.sids)

#Now, my map and my limits, I want to plot the 74 birth rate:
myMap = geom_map(inherit.aes = FALSE, aes(fill=BIR74,map_id=id), map=ncFort,data=nc.sids@data)
Limits = expand_limits(x=ncFort$long,y=ncFort$lat)

# and on a blank plot I can:
ggplot() + myMap + Limits

# but on a ggmap I cant:
ggmap(ncmap) + myMap + Limits 

最后一行代码的结果是: