numpy 初学者：使用 numpy.savetxt 编写数组

Question

我有一个 numpy 直方图，我想将其输出为制表符分隔的文本文件。我的代码如下：

targethist = np.histogram(targetlist, bins=ilist)
print targethist
np.savetxt('ChrI_dens.txt',targethist,delimiter='\t')

targetlist 和 ilist 是长整数列表。我得到以下输出：

(array([0, 0, 0, ..., 0, 0, 0]), array([ 1, 10000, 20000, ..., 15060000, 15070000, 15072422])) 回溯（最近一次调用） ：文件“target_dens_np.py”，第 62 行，在 np.savetxt('ChrI_dens.txt',targethist,delimiter='\t') 文件“/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/7.3/lib/python2. 7/site-packages/numpy/lib/npyio.py”，第 979 行，在 savetxt fh.write(asbytes(format % tuple(row) + newline)) 中 TypeError：需要 float 参数，而不是 numpy.ndarray

似乎直方图数组已创建，但我在 np.savetxt() 行中做错了一些事情。我已阅读文档，但不明白为什么此函数中的任何参数都需要浮点数。我哪里出错了？

Answer 1

我认为问题在于第二个参数savetxt必须是“类似数组”。您的输入不是“类似数组”。例如

print (len(targethist[0]))
print (len(targethist[1]))

注意到长度不一样了吗？如果长度相同，numpy 可以将其转换为单个二维数组，一切都会很好，但它无法进行转换，因此会失败。

这有效

np.savetxt('stuff.dat',(targethist[0],targethist[1][1:]),delimiter='\t')

但我已经截断了你的数据；）。您需要决定要采取什么措施来解决这个问题。

我必须承认，这里的错误消息非常神秘。