DataFrame
根据这个例子,我正在使用Pandas 进行逐行t检验:
import numpy
import pandas
df = pandas.DataFrame(numpy.log2(numpy.randn(1000, 4),
columns=["a", "b", "c", "d"])
df = df.dropna()
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现在,假设我将"a"和"b"作为一个组,而"c"和"d"作为另一个组,我正在逐行执行t检验.这对于pandas来说相当简单,使用apply
axis = 1.但是,如果我的函数没有聚合,我可以返回相同形状的DataFrame,如果聚合则返回Series.
通常我只输出p值(所以,聚合),但我想基于其他计算生成一个额外的值(换句话说,返回两个值).我当然可以做两次运行,首先聚合p值,然后进行其他工作,但我想知道是否有更有效的方法可以做到这一点,因为数据相当大.
作为计算的一个例子,一个hypotethical函数将是:
from scipy.stats import ttest_ind
def t_test_and_mean(series, first, second):
first_group = series[first]
second_group = series[second]
_, pvalue = ttest_ind(first_group, second_group)
mean_ratio = second_group.mean() / first_group.mean()
return (pvalue, mean_ratio)
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然后调用
df.apply(t_test_and_mean, first=["a", "b"], second=["c", "d"], axis=1)
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当然,在这种情况下,它返回一个以两个元组为值的系列.
相反,ny预期输出将是具有两列的DataFrame,一列用于第一个结果,一列用于第二列.这是可能的还是我必须为两次计算做两次运行,然后将它们合并在一起?
Gar*_*ett 75
返回一个系列,而不是元组,应该产生一个新的多列DataFrame.例如,
return pandas.Series({'pvalue': pvalue, 'mean_ratio': mean_ratio})
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