使用Eclipse和Rserve从Java调用R的简单程序

Question

我的应用程序必须执行R操作,例如:

m = matrix(sample(0:1,100, rep=T),ncol=10)

结果应该可供Java应用程序使用.

所述Rserve包桥R 1至其他语言,因为它作为一个TCP/IP服务器.我已阅读该网站,但不知道如何制作可以使用Rserve的最简单的应用程序.

制作一个使用Rserve从Java执行R命令的简单Eclipse应用程序需要哪些步骤？

Answer 1

下载部分有一个二进制版本的Rserve(www.rforge.net/Rserve/files/我有版本R 2.13和Windows xp,所以我需要下载Windows二进制文件:Rserve_0.6-8.zip(541.3kb,更新) :Wed Apr 18 07:00:45 2012)).将文件复制到包含R.DLL的目录.从CRAN安装Rserve后

install.packages("Rserve")

在R(我有RStudio - 方便的事情:下载RStudio IDE).开始Rserve来自R内,只需输入

library(Rserve)
Rserve()

Сheck在任务管理器中 - 应该运行Rserve.exe.在Eclipse中创建Java项目之后,在该项目下创建一个名为lib的目录.在这里粘贴2罐RserveEngine.jar和REngine.jar(www.rforge.net/Rserve/files/).不要忘记在属性java-project中添加这个jar.在新的类代码中:

import org.rosuda.REngine.*;
import org.rosuda.REngine.Rserve.*;

public class rserveuseClass {
    public static void main(String[] args) throws RserveException {
        try {
            RConnection c = new RConnection();// make a new local connection on default port (6311)
            double d[] = c.eval("rnorm(10)").asDoubles();
            org.rosuda.REngine.REXP x0 = c.eval("R.version.string");
            System.out.println(x0.asString());
} catch (REngineException e) {
            //manipulation
        }       

    }
}

Answer 2

以下是从头开始创建RServe项目的更详细说明:

首先安装并让Rserve在R中运行

1. 安装R.
2. 从CRAN添加包RServe.
3. 在R类型:install.packages("Rserve")

对于远程访问:

• 创建文件:/etc/Rserv.conf

将以下内容添加到Rserv.conf中

workdir /tmp/Rserv
remote enable
auth required
plaintext disable
port 6311
maxsendbuf 0 (size in kB, 0 means unlimited use)

在R中:运行以下命令

library(Rserve)

对于Windows:

Rserve()

对于Mac:

Rserve(args="--no-save")

Rserve的实例现在在localhost端口6311上运行.

下一步创建一个Rserve项目(我正在使用eclipse)

为此,我将使用eclipse:

1. 从这里下载RserveEngine.jar和REngine.jar .
2. 在eclipse中创建一个java项目.
3. 在项目目录下创建一个lib文件夹.(与您的src文件夹相同)
4. 将RserveEngine.jar和REngine.jar复制到lib文件夹中.
5. 添加jar来构建路径:说明
6. 添加一个包然后添加一个主类:称之为HelloWorldApp.

将此代码添加到类中

package com.sti.ai;

import java.io.BufferedReader;
import java.io.File;
import java.io.FileNotFoundException;
import java.io.FileReader;
import java.io.IOException;

import org.rosuda.REngine.REXP;
import org.rosuda.REngine.REXPMismatchException;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RserveException;

public class HelloWorldApp {

    public static void main(String[] args) throws RserveException, REXPMismatchException, FileNotFoundException, IOException {
        RConnection c = new RConnection("<host/ip>", 6311);
        if(c.isConnected()) {
            System.out.println("Connected to RServe.");
            if(c.needLogin()) {
                System.out.println("Providing Login");
                c.login("username", "password");
            }

            REXP x;
            System.out.println("Reading script...");
            File file = new File("<file location>");
            try(BufferedReader br = new BufferedReader(new FileReader(file))) {
                for(String line; (line = br.readLine()) != null; ) {
                    System.out.println(line);
                    x = c.eval(line);         // evaluates line in R
                    System.out.println(x);    // prints result
                }
            }

        } else {
            System.out.println("Rserve could not connect");
        }

        c.close();
        System.out.println("Session Closed");
    }

}

最后,运行HelloWorldApp.java

对于那些使用Maven的人

REngine

<dependency>
    <groupId>org.nuiton.thirdparty</groupId>
    <artifactId>REngine</artifactId>
    <version>1.7-3</version>
</dependency>

RServe

<dependency>
    <groupId>org.rosuda.REngine</groupId>
    <artifactId>Rserve</artifactId>
    <version>1.8.1</version>
</dependency>