我必须通过因子找出连续变量的累积频率(换算成百分比).例如:
data <- data.frame(n = sample(1:12),
d = seq(10, 120, by = 10),
Site = rep(c("FirstSite", "SecondSite"), 6),
Plot = rep(c("Plot1", "Plot1", "Plot2", "Plot2"), 3)
)
data <- with(data, data[order(Site,Plot),])
data <- transform(data, G = ((pi * (d/2)^2) * n) / 10000)
data
n d Site Plot G
1 7 10 FirstSite Plot1 0.05497787
5 9 50 FirstSite Plot1 1.76714587
9 12 90 FirstSite Plot1 7.63407015
3 10 30 FirstSite Plot2 0.70685835
7 5 70 FirstSite Plot2 1.92422550
11 1 110 FirstSite Plot2 0.95033178
2 3 20 SecondSite Plot1 0.09424778
6 8 60 SecondSite Plot1 2.26194671
10 6 100 SecondSite Plot1 4.71238898
4 4 40 SecondSite Plot2 0.50265482
8 2 80 SecondSite Plot2 1.00530965
12 11 120 SecondSite Plot2 12.44070691
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我需要列的cumulaive频率G的因素Plot~Site,以情节的geom_step ggplot G对d每个情节和站点.
我已经实现了G通过因子计算累积和:
data.ss <- by(data[, "G"], data[,c("Plot", "Site")], function(x) cumsum(x))
# Gtot
(data.ss.tot <- sapply(ss, max))
[1] 9.456194 3.581416 7.068583 13.948671
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现在我需要Plot G在范围[0..1]中表达每个,其中1表示G每个Plot.我想我应该除以G它Plot Gtot,然后应用一个新的cumsum.怎么做?
请注意,我必须绘制这个累积频率而d不是G自己,因此它不是一个合适的ecdf.
谢谢.
我经常使用ddply和transform做这类事情:
> data = ddply(data, c('Site', 'Plot'), transform, Gsum=cumsum(G), Gtot=sum(G))
> qplot(x=d, y=Gsum/Gtot, facets=Plot~Site, geom='step', data=data)
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