如何在R中的列表中组合不同长度的向量？

Question

组合列表中包含的以下向量时遇到问题:

x <- list(as.numeric(c(1,4)),as.numeric(c(3,19,11)))
names (x[[1]]) <- c("species.A","species.C")
names (x[[2]]) <- c("species.A","species.B","species.C")

给出以下列表:

>x
>[[1]]
>species.A species.C 
>         1         4 
>[[2]]
>species.A species.B species.C 
>        3        19        11 

使用do.call函数组合它们: y<- do.call(cbind,x)

得到:

>y
>             [,1] [,2]
>   species.A    1    3
>   species.B    4   19
>   species.C    1   11

虽然我想获得这个:

>             [,1] [,2]
>   species.A    1    3
>   species.B   NA   19
>   species.C    4   11

Answer 1

首先要准备最终要cbind在一起的所有相同长度的特定向量，这需要给R多一点帮助。否则（如您所见），R使用其通常的回收规则填充矩阵。

尝试这样的事情：

spp <- paste("species", c("A", "B", "C"), sep=".")

x2 <- lapply(x, FUN=function(X) X[spp])
mat <- do.call("cbind", x2)
row.names(mat) <- spp

mat
          [,1] [,2]
species.A    1    3
species.B   NA   19
species.C    4   11

编辑：正如Brian在评论中提到的那样，这可以变得更加紧凑（但要牺牲一些可读性）。您使用哪一个只是一个品味问题：

mat <- do.call("cbind", lapply(x, "[", spp))
row.names(mat) <- spp

Answer 2

看起来你真的想要合并.因此,merge将工作.你只需告诉它合并名称,并保留所有行.

do.call(merge, c(x, by=0, all=TRUE))   # by=0 and by="row.names" are the same

(这将创建一个数据框而不是矩阵,但对于大多数目的来说,这应该不是问题.)