geom_raster()的相对性能

Question

我有一个R/ ggplot2用例似乎需要geom_raster:一个常规的笛卡尔网格,在x,y位置有z值.我一直在使用geom_tile,我期望从切换到性能改进geom_raster.但我似乎没有看到一个......

这是一个玩具示例(但大小合适),使用base图形:

n <- m <- 200
x <- 1:n
y <- 1:m
f <- function(x, y) 10 * sin(x / n) * cos(y / m)
z <- outer(x, y, f)
system.time(image(z))

   user  system elapsed 
  0.998   0.007   1.023 

这是ggplot2:

obs <- expand.grid(x=x, y=y)
obs$z <- as.numeric(as.list(z))
require(ggplot2)
p <- ggplot(obs, aes(x=x, y=y, fill=z))
system.time(show(p + geom_tile()))

   user  system elapsed 
  7.328   0.891   8.187 

require(ggExtra)
system.time(show(p + geom_raster()))

   user  system elapsed 
  7.000   0.637   7.799

所以,适度增长,但远不及我的期望.我做错了吗？提前谢谢了!

Answer 1

你应该使用geom_raster最新的ggplot2(dev版本,当前),而不是有缺陷的原型ggExtra(这个包现在已经弃用了,顺便说一句).

这样做,我得到了更好的结果,4.705对1.416(已过去).相当不错.

编辑:事实证明,?geom_raster在ggplot2已经提供了更好的基准,我的系统上

benchplot(base + geom_raster())
       step user.self sys.self elapsed
1 construct     0.006    0.004   0.010
2     build     0.887    0.212   1.109
3    render     0.449    0.119   0.584
4      draw     0.108    0.005   0.141
5     TOTAL     1.450    0.340   1.844
> benchplot(base + geom_tile())
       step user.self sys.self elapsed
1 construct     0.016    0.005   0.026
2     build     1.031    0.329   1.365
3    render     1.021    0.297   1.318
4      draw     0.987    0.041   1.040
5     TOTAL     3.055    0.672   3.749