AWR*_*RAM 2 string perl loops pattern-matching match
我正在努力比较2个子串sub1和sub22个初始字符串seq1,seq2只允许一个不匹配的$k是子序列的长度
foreach (my $i = 0; $i < length($seq1) - $k; $i += 1) {
my $sub1 = substr($seq1, $i, $k);
foreach (my $j = 0; $j < length($seq2) - $k; $i++) {
my $sub2 = substr($seq2, $j, $k);
my $diff = $sub1 ^ $sub2;
my $num_mismatch = $diff =~ tr/\0//c;
if ($num_mismatch == 1) {
$d{$sub1}++;
}
}
}
foreach (keys %d) {
print "$_\n";
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
*当我运行代码它被卡住直到我杀死进程并且它不会给出任何结果.对此有何帮助?*
Emi*_*lva 11
foreach (my $j=0;$j<length($seq2)-$k;$i++)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
应该
foreach (my $j=0;$j<length($seq2)-$k;$j++)
# ^^
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
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