Dav*_*uer 13 hardware graphics plot r ggplot2
我想提高绘图的速度,我很满意(并且需要很多代码)R图形和ggplot包 - 所以我只想知道如何配置我的系统来加速绘图.
特别:
更新:评论中的问题答案:
规格:Ubuntu 11.04,intel Core Duo,8GB ram,但我更感兴趣的是图形计算或图形渲染是限制性的,如果是这样,我该如何使用这些信息.
我的情节有很多对象,但我不知道绘图的计算成本是多少.我在绘图时没有做任何具体的分析(我在完成任何必要的分析之后进行绘图),虽然我知道有些是"动态"完成的,就像绘制平滑线或甚至将数据转换到位置时一样.
除非你有计算机密集型单一图,否则加速多次绘图的好方法是并行处理.例如,假设您有一个数据帧,并且您希望通过某个变量(或变量)将其分解,并为每个分区绘制图表.
注册并行后端的方法有很多种,所以我不再赘述.例如,请参阅此插图:http://cran.r-project.org/web/packages/doSMP/vignettes/gettingstartedSMP.pdf
然后查看ddply
Hadley plyr
软件包中的函数并使用该.parallel = TRUE
选项.基本上就是这样.然后只是正常绘图.
这是一个自包含的例子:
#this is the particular library I chose to register a parallel backend. There are others. See the new "Parallel R" book for details.
library(doMC)
registerDoMC()
getDoParWorkers() #This lists how many workers you have (hopefully more than 1!)
library(ggplot2)
ddply(
mtcars, .variables = "vs", .fun = function(x) {
#do your plotting now
example_plot <- ggplot(x, aes(y = mpg, x = wt)) + geom_point() + geom_smooth(se = FALSE)
#save your plot
ggsave(paste(x$vs[1],".pdf",sep = ""), example_plot)
},
.parallel = TRUE
)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这将保存两个文件,即.pdf和1.pdf,它们是数据帧vs
变量的级别(即唯一值)mtcars
.如果您将其分解为变量,country name
则保存的文件将是国家/地区的名称.0.pdf和1.pdf如下:
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