Ben*_*min 7 python numpy scipy
我正在尝试编写一个曲线拟合函数,它返回最佳参数a,b和c,这是一个简化的例子:
import numpy
import scipy
from scipy.optimize import curve_fit
def f(x, a, b, c):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
xdata = numpy.array([1,3,6,8,10])
ydata = numpy.array([ 0.91589774, 4.91589774, 10.91589774, 14.91589774, 18.91589774])
popt, pcov = scipy.optimize.curve_fit(f, xdata, ydata)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这工作正常,但我想让用户有机会提供一些(或没有)参数a,b或c,在这种情况下,它们应被视为常量而不是估计.如何编写f
以使其仅适合用户未提供的参数?
基本上,我需要f
使用正确的参数动态定义.例如,如果a
用户已知,则f
变为:
def f(x, b, c):
a = global_version_of_a
return x * 2*a + 4*b - 5*c
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
从collections.namedtuple playbook中获取页面,您可以使用exec"动态"定义func
:
import numpy as np
import scipy.optimize as optimize
import textwrap
funcstr=textwrap.dedent('''\
def func(x, {p}):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
''')
def make_model(**kwargs):
params=set(('a','b','c')).difference(kwargs.keys())
exec funcstr.format(p=','.join(params)) in kwargs
return kwargs['func']
func=make_model(a=3, b=1)
xdata = np.array([1,3,6,8,10])
ydata = np.array([ 0.91589774, 4.91589774, 10.91589774, 14.91589774, 18.91589774])
popt, pcov = optimize.curve_fit(func, xdata, ydata)
print(popt)
# [ 5.49682045]
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注意这一行
func=make_model(a=3, b=1)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
您可以将任何您喜欢的参数传递给make_model.您传递的参数将make_model
成为固定常量func
.无论什么参数仍然是optimize.curve_fit
试图适合的自由参数.
例如,上面,a = 3和b = 1成为固定常数func
.实际上,该exec
语句将它们放在func
全局命名空间中.func
因此被定义为x
单个参数的函数c
.请注意,返回值为popt
长度为1的数组,对应于剩余的自由参数c
.
关于textwrap.dedent
:在上面的例子中,调用textwrap.dedent
是不必要的.但是在"真实"脚本中,在funcstr
函数内部或更深的缩进级别定义,textwrap.dedent
允许您编写
def foo():
funcstr=textwrap.dedent('''\
def func(x, {p}):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
''')
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
而不是视觉上没有吸引力
def foo():
funcstr='''\
def func(x, {p}):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
'''
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
有些人更喜欢
def foo():
funcstr=(
'def func(x, {p}):\n'
' return x * 2*a + 4*b - 5*c'
)
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但我发现分别引用每一行并添加明确的EOL字符有点麻烦.但它确实为您保存了一个函数调用.