中断循环与系统命令

Question

我正在越来越多地使用Rscript,我通常会使用bash脚本.一个小烦恼是,许多这些脚本循环一些system()调用,如果我试图中断它,R基本上没有时间来捕获我的控制-c.相反,它只是中止正在运行的系统命令并继续下一个循环迭代.例如,当我尝试通过按住control-c来中断以下操作时,它仍然会通过所有迭代:

for(i in 1:10) {
  cat(i)
  system('sleep 3')
}

到目前为止,我总是通过在每个循环中插入一个小暂停来解决这个问题

for(i in 1:10) {
  Sys.sleep(0.25)
  cat(i)
  system('sleep 3')
}

如果我按住control-c,这将让我在一两次迭代中中止,但我想知道,有没有更有效的方法来实现这种行为？

Answer 1

约翰，我不确定这是否有帮助，但通过调查setTimeLimit，我了解到只要用户能够执行中断（例如 Ctrl-C），它就可以停止执行。请参阅此问题以获取一些参考资料。

特别是，回调可能是一种可行的方法，我会在developer.r-project.org上查看本addTaskCallback指南。

以下是其他四项建议：

1. 虽然这是一种 hack，但我可以采用一种非常不同的方法来调用两个 R 会话，一个是主会话，另一个只是为了执行主会话传递的 shell 命令，它只等待确认工作已完成，然后再开始下一个。

2. 如果您可以使用foreach替代for（并行，通过％dopar％，或串行％do％而不是％dopar％或仅使用1个注册工人），这可能更容易受到干扰，因为它可能相当于第一个建议（因为它分叉了 R）。

3. 如果您可以检索外部命令的退出代码，则可以将其传递给循环条件。 之前的问答在这方面会有所帮助。

4. 如果您想让所有内容都在 bash 脚本中运行，那么 R 可以只编写一个长脚本（即将一个字符串或一系列字符串输出到文件中）。这可以被执行，并且保证中断不会影响循环，因为您已经展开了循环。或者，您可以在 bash 中编写循环。 以下是示例。find就我个人而言，我喜欢使用(例如)将命令应用于文件find .... -exec doStuff {} ';'或通过反引号作为输入。不幸的是，我不能轻易地在 SO 上给出格式良好的代码，因为它在反引号中嵌入了反引号... 请参阅此页的示例 因此，可能的情况是您可以有一个命令，没有循环，并应用一个命令函数适用于满足一组特定条件的所有文件。对于 bash 用户来说，通过反引号使用命令替换是一个非常方便的技巧。