基于正则表达式合并多个文件

Question

如何使用 for 循环合并下划线之前具有匹配字符/数字的两个文件？我的目录中有很多文件

输入：

SRR9200887_1.fastq
SRR9200887_2.fastq
SRR9200888_1.fastq
SRR9200888_2.fastq
SRR9200889_1.fastq
SRR9200889_2.fastq

预期输出：

SRR9200887.fastq
SRR9200888.fastq
SRR9200889.fastq

我的尝试：

for l in $(ls *.fastq | cut -d_ -f1 | sort |uniq); do cat ${l}*.fastq

Answer 1

及其bash参数扩展：

for i in *_1.fastq; do
  cat "${i%_*.fastq}_1.fastq" "${i%_*.fastq}_2.fastq" > "${i%_*.fastq}.fastq";
done

${i%_*.fastq}输出$i没有_和所有跟随它的，例如SRR9200887。