did*_*mos 2 python r bioconductor hidden-markov-models
你知道如何在python,R(Bioconductor)中实现HMM的任何好的文献和/或教程吗？(特别是用于序列分析)
CRAN上有HMM包,这可能是一个很好的起点.
http://cran.at.r-project.org/web/packages/HMM/index.html
这很容易从R本身找到:
RSiteSearch("HMM")
GHMM for python有一个教程,但它很简短,他们承认" 目前,GHMM完全缺乏文档. "
我喜欢Rabiner纸.
我有关于使用HMM进行遗传作图的技术报告.
我建议阅读一些Rabiner然后实现一些东西.前向/后向方程只是几行.
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