ggplot热图传奇不代表负数

Question

我正在尝试为包含负数的数据集制作热图:

Ne      BR         Error  
10000   0.00001    1.62  
10000   0.000001  -1.03  
10000   0.0000001 -0.124  
100000  0.00001   36.73  
100000  0.000001   5.86  
100000  0.0000001 -0.79  
1000000 0.00001   -8.335  
1000000 0.000001  39.465  
1000000 0.0000001  2.59  

我用过这段代码:

library(ggplot2)  
data = read.csv('full_path')  
(p <- ggplot(data[1:9,], aes(Ne, BR)) +
  geom_tile(aes(fill=Error), colour="white") + 
  scale_fill_gradient(low="white", high="black") + scale_x_log('Ne') +    
  scale_y_log('Birth Rate') + opts(axis.ticks = theme_blank()))  

这会产生精细的热图,但图例并未考虑负数.颜色似乎正确反映负值,但图例停在零,即浅灰色.如何从中获取涵盖数据框"错误"列中所有数据的图例？

Answer 1

试试这个:

ggplot(dat, aes(Ne, BR)) +
  geom_tile(aes(fill=Error), colour="white") + 
  scale_fill_gradient(low="white", high="black",breaks = seq(min(dat$Error),max(dat$Error),length.out = 5)) + scale_x_log('Ne') +    
  scale_y_log('Birth Rate') + opts(axis.ticks = theme_blank()) 

ggplot只是试图为你选择"好"的刻度,类似于选择轴刻度线的方式.(我将您的数据框名称更改为dat,这data是R中常用的函数.这不是一个大问题,但它避免了混淆.)