将另一行的前缀添加到每个字符串

Question

我有一个文件：

# Sequence Data: seqnum=1;seqlen=3142;seqhdr="GUT_GENOME148255_1"
>1_59_1276_-
>2_1339_1842_-
>3_1873_2436_-
>4_2470_2928_-
# Sequence Data: seqnum=2;seqlen=3085;seqhdr="GUT_GENOME148255_2"
>1_3_266_-
>2_256_1038_-
# Sequence Data: seqnum=3;seqlen=3050;seqhdr="GUT_GENOME148255_3"
>1_22_1062_-
>2_1072_1746_-
>3_1767_3017_-
# Sequence Data: seqnum=4;seqlen=2934;seqhdr="GUT_GENOME148255_4"
>1_83_436_-
>2_438_1430_-
>3_1432_1872_-
>4_1986_2933_+

我想添加与seqnum以 开头的每一行对应的数字>，这样它看起来像这样：

# Sequence Data: seqnum=1;seqlen=3142;seqhdr="GUT_GENOME148255_1"
>1-1_59_1276_-
>1-2_1339_1842_-
>1-3_1873_2436_-
>1-4_2470_2928_-
# Sequence Data: seqnum=2;seqlen=3085;seqhdr="GUT_GENOME148255_2"
>2-1_3_266_-
>2-2_256_1038_-
# Sequence Data: seqnum=3;seqlen=3050;seqhdr="GUT_GENOME148255_3"
>3-1_22_1062_-
>3-2_1072_1746_-
>3-3_1767_3017_-
# Sequence Data: seqnum=4;seqlen=2934;seqhdr="GUT_GENOME148255_4"
>4-1_83_436_-
>4-2_438_1430_-
>4-3_1432_1872_-
>4-4_1986_2933_+

该过程应该遍历整个文件。我怀疑这是可以做到的，awk但我的努力是没有用的。

Answer 1

这可能对你有用（GNU sed）：

sed -E '/seqnum=/h;/^>/G;s/^>(.*)\n[^0-9]+([0-9]+).*/>\2-\1/' file

复制包含 的行seqnum。

对于以 开头的每一行>，附加副本并使用模式匹配和反向引用，根据需要设置格式。