read.delim() - 错误"比列名更多的列"和"标题和''col.names"具有不同的长度"

Question

初步信息 操作系统:Windows XP Professional版本2002 Service Pack 3; R版本:R 2.12.2(2011-02-25)

我试图使用该read.delim()函数读取一个30,000行80列,制表符分隔的文本文件到R中.此文件的列标题具有以下命名约定:"_".我用来尝试读取数据的代码是:

cc <- c("integer", "character", "integer", rep("character", 3), 
        rep("integer", 73))

example_data <- read.delim(file = 'C:/example.txt', row.names = FALSE,
                           col.names = TRUE, as.is = TRUE, colClasses = cc)

提交此命令后,我收到以下错误消息:

Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote,  : 
more columns than column names
In addition: Warning message:
In read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote,  :
  header and 'col.names' are of different lengths

可能很重要的信息 - 从第8列到第80列,每列中的零计数如下:

column 08: 29,000 zeros
column 13: 15,000 zeros
column 19: 500 zeros
column 43: 15,000 zeros
columns 65-80: 29,000 zeros for each column

任何人都可以帮助确定我收到上述错误消息的原因吗？任何帮助将不胜感激.

Answer 1

问题的原因是你使用了这个col.names=TRUE论点.这应该手动用于指定结果数据框的列名,因此必须是一个与输入中的列长度相同的向量,每列一个名称.

如果您想read.delim从文件中获取列名,请考虑使用header=TRUE; 您可能还希望重新考虑row.names=TRUE,这是作为行名称的规范而不是从文件中读取它们的指令.

有关详细信息,请参阅帮助页面read.delim.

Answer 2

我最近也有同样的错误,它在将文件转换为逗号或分号分隔后消失,并用read.csv/read.csv2读取它.我知道这不是一个完整的答案,但也许你可能会检查出来.