绘制带有 numpy 数组错误的 NetworkX 图形

Question

我将邻接矩阵作为 numpy 数组，并希望使用 NetworkX 将其绘制为简单的无向图，但我不断遇到此错误：AttributeError: module 'scipy.sparse' has no attribute 'coo_array'

我正在关注这个：Plot NetworkX Graph from Adjacency Matrix in CSV file特定答案，但无法让它工作。唯一的区别是我的邻接矩阵相当大，大约有 30000 列

这是我的图形绘制代码：

G = nx.from_numpy_matrix(np.matrix(adj_mtx_np), create_using=nx.DiGraph)
nx.draw(G)
plt.show()

我的scipy版本是1.8.0

Answer 1

将networkx降级到2.6.3，它为我解决了这个问题。

Answer 2

升级两者scipy并且networkx它对我有用。

pip install --upgrade scipy networkx

Answer 3

我查看了生成该错误的 scipy 文件 ("convert_matrix.py") 第 921 行： A = sp.sparse.coo_array((d, (r, c)), shape=(nlen, nlen), dtype=dtype ）。

您需要将“coo_array”切换为“coo_matrix”。

所以它应该看起来像： A = sp.sparse.coo_matrix((d, (r, c)), shape=(nlen, nlen), dtype=dtype)

这对我的项目来说已经足够好了