在 mac m1 上用 python 安装 geopandas 时出错

Question

我正在尝试在我的 M1 mac 上安装 geopandas，但遇到错误

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我尝试单独 pip 安装所有依赖项，但我遇到问题的是 pyproj 的安装。

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我使用brew install proj安装了PROJ，效果很好

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当我尝试 pip install pyproj 时，出现以下错误

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Building wheels for collected packages: pyproj  \n\nBuilding wheel for pyproj (pyproject.toml) ... error\n  error: subprocess-exited-with-error\n  \n  \xc3\x97 Building wheel for pyproj (pyproject.toml) did not run successfully.\n  \xe2\x94\x82 exit code: 1\n  \xe2\x95\xb0\xe2\x94\x80> [12 lines of output]\n      PROJ_DIR is set, using existing PROJ installation..\n      \n      running bdist_wheel\n      running build\n      running build_py\n      running build_ext\n      building 'pyproj._geod' extension\n      pyproj/_geod.c:704:10: fatal error: 'geodesic.h' file not found\n      #include "geodesic.h"\n               ^~~~~~~~~~~~\n      1 error generated.\n      error: command '/usr/bin/clang' failed with exit code 1\n      [end of output]\n  \n  note: This error originates from a subprocess, and is likely not a problem with pip.\n  ERROR: Failed building wheel for pyproj\nFailed to build pyproj\nERROR: Could not build wheels for pyproj, which is required to install pyproject.toml-based projects\n

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任何帮助将非常感激

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Answer 1

目前，在 M1 mac 上安装 geopandas 可以通过 conda 或 pip+homebrew 来实现。

GeoPandas 本身是用纯 Python 编写的，因此在任何架构上运行都没有问题。然而，它依赖于用其他语言（C、C++）编写的其他库，需要专门为M1芯片编译。虽然您可以自己编译它，但我不会介绍此选项，因为它对用户不友好。

所需库有三种可能的来源 - pipwheels、conda-forge 和 Homebrew。

当Python包需要C依赖时，它可以使用针对每个系统和芯片架构编译的依赖来创建轮子。例如，请参见 pygeos - https://pypi.org/project/pygeos/#files。你需要的是*macosx_11_0_arm64.whl . 如果您的软件包没有提供它，您必须找到除 之外的另一种安装方式pip。由于 GeoPandas 需要 shapely 和 fiona（以及其他），而它们没有这些轮子，因此您应该寻找其他地方 - 无论是 conda-forge 还是 Homebrew。以下是截至今天测试的两个选项。

conda和conda-forge方式（推荐）

Conda-forge 目前拥有 geopandas 需要的所有包

安装 M1 版本的 miniforge 或 mambaforge。可以从这里下载 - https://github.com/conda-forge/miniforge。

conda install -c conda-forge geopandas pygeos

注意：如果您安装 x86（Intel）版本的 conda，它将在 Rosetta2 下运行并使用 x86 架构安装所有软件包，这意味着所有内容都将在模拟下运行。尽量避免这种情况。

Pip 和 Homebrew 方式

Homebrew 可以安装为 M1 编译的 C 库。Python 包将找到并使用它们。

使用Python 3.9的环境

安装整齐：

brew install geos
export DYLD_LIBRARY_PATH=/opt/homebrew/opt/geos/lib/
pip install shapely

DYLD_LIBRARY_PATHShapely 需要找到 GEOS 安装。

安装菲奥娜：

brew install gdal
pip install fiona

安装pyproj：

brew install proj
pip install pyproj

安装 geopandas 和 pygeos 以提高速度：

brew install gdal
pip install fiona

请注意，这是我自己在https://github.com/geopandas/geopandas/issues/1816#issuecomment-1003093329中给出的解释的复制粘贴。