使用Win7 64位上的rJava包和R

Question

我正在尝试rJava在Win 7 64位的计算机上安装.我跑的时候

install.packages("rJava")

一切似乎都很好:

Installing package(s) into ‘C:/Users/djq/Documents/R/win-library/2.13’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://software.rc.fas.harvard.edu/mirrors/R/bin/windows/contrib/2.13/rJava_0.9-1.zip'
Content type 'application/zip' length 654936 bytes (639 Kb)
opened URL
downloaded 639 Kb

package 'rJava' successfully unpacked and MD5 sums checked

The downloaded packages are in
    C:\TEMP\RtmpW2eAUw\downloaded_packages

但是当我尝试加载库时,library(rJava)我收到以下错误:

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...)
  error: unable to load shared object 'C:/Users/me/Documents/R/win-library/2.13/rJava/libs/x64/rJava.dll':
  LoadLibrary failure:  %1 is not a valid Win32 application.

Error: package/namespace load failed for 'rJava'

我已经安装了Java JRE(尝试32位和64位版本)和JDK(使用32位和64位).我的R版本是R version 2.13.1 (2011-07-08),我正在使用RStudio.

如果我尝试使用32位R,我可以正常加载rJava.问题就是rJava不能在R 64位中运行吗？如何确定包是否仅适用于32而不是64？

---

编辑:刚发布R.version():

> R.Version()
$platform
[1] "x86_64-pc-mingw32"

$arch
[1] "x86_64"

$os
[1] "mingw32"

$system
[1] "x86_64, mingw32"

$status
[1] ""

$major
[1] "2"

$minor
[1] "13.1"

$year
[1] "2011"

$month
[1] "07"

$day
[1] "08"

$`svn rev`
[1] "56322"

$language
[1] "R"

$version.string
[1] "R version 2.13.1 (2011-07-08)"

Answer 1

更新(2018年7月):

rJava的最新CRAN版本将jvm.dll自动找到,无需手动设置PATH或JAVA_HOME.但请注意:

• 要在32位R中使用rJava,需要Java for Windows x86
• 要在64位R中使用rJava,需要Java for Windows x64
• 要使用multi-arch(默认)构建或检查R包,您需要 安装 Java For Windows x64以及Java for Windows x86.在Win 64上,前者安装在C:\Program files\Java\后者中,后者安装在后面,C:\Program Files (x86)\Java\因此它们不会发生冲突.

从Java版本9开始,对x86(win32)的支持已经停止.因此,最新的工作多拱设置是安装jdk-8u172-windows-i586.exe和jdk-8u172-windows-x64.exe,然后安装CRAN的二进制包:

install.packages("rJava")

来自CRAN的二进制包应该自己选择jvm.仅限专家:要从源代码构建rJava,您需要--merge-multiarch标记:

install.packages('rJava', type = 'source', INSTALL_opts='--merge-multiarch')

老安瑟:

(注意:其他答案/评论中的许多人都说要删除JAVA_HOME,所以考虑一下.我最近没有重新讨论这个问题,知道下面的所有步骤是否仍然是必要的.)

以下是有关如何在Windows 7 64位上启动和运行R + rJava的快速建议.有几种可能性,但大多数都有致命的缺陷.这对我有用:

将jvm.dll添加到您的PATH

R < - > Java桥接器rJava将需要jvm.dll,但R将无法找到该DLL.它驻留在像这样的文件夹中

C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_25\jre\bin\server

要么

C:\Program Files\Java\jre6\jre\bin\client

无论你在哪里,将该目录添加到你的Windows PATH变量.(Windows - >"路径" - >"为您的帐户编辑环境变量" - >路径 - >编辑值.)

您可能已经在PATH上安装了Java.如果是这样,您应该在与PATH上已有的Java"home"目录中找到客户端/服务器目录.

为了安全起见,请确保您的架构匹配.如果您有Java Program Files,它是64位,所以您应该运行R64.如果你有Java Program Files (x86),那是32位,所以你使用普通的32位R.

从Windows菜单重新启动R.

如果R正在运行,请退出.

从开始菜单,启动R/RGUI,RStudio.这是非常重要的,以使R获取您的PATH更改.

安装rJava 0.9.2.

早期版本不起作用!镜像不是最新的,所以请访问www.rforge.net上的来源:http://www.rforge.net/rJava/files/ .注意那里的建议

“Please use

`install.packages('rJava',,'http://www.rforge.net/')`

to install.”

这几乎是正确的.这实际上有效:

install.packages('rJava', .libPaths()[1], 'http://www.rforge.net/')

观看标点符号!神秘的".libPaths()[1],"只是告诉R将软件包安装在主库目录中.出于某种原因,将值保留为空白不起作用,即使它应该是默认值.

Answer 2

让rJava工作在很大程度上取决于您的计算机配置:

1. 您必须使用相同的 32位或64位版本:R和JDK/JRE.这种混合物永远不会起作用(至少对我而言).

2. 如果使用64位版本确保,则不要将JAVA_HOME设置为环境变量.如果设置了这个变量,rJava将无法用于任何原因(至少对我而言).您可以轻松检查R是否设置了JAVA_HOME

   Sys.getenv("JAVA_HOME")
   

如果您需要设置JAVA_HOME(例如,您需要maven或其他东西),您可以在加载rJava之前使用以下代码在R-session中停用它:

if (Sys.getenv("JAVA_HOME")!="")
  Sys.setenv(JAVA_HOME="")
library(rJava)

在大多数情况下,这应该可以解决问题.此外,这将解决问题使用R7上的Win7 64位上的rJava包.我借用了从R:rJava包安装失败中取消设置环境变量的想法.

Answer 3

对我来说,设置 JAVA_HOME可以解决问题(而不是取消设置,如此处给出的另一个答案).在Windows中:

set JAVA_HOME="C:\Program Files\Java\jre7\"

或者在R里面:

Sys.setenv(JAVA_HOME="C:\\Program Files\\Java\\jre7\\")

但是什么可能是最好的解决方案(因为rJava 0.9-4)完全覆盖了R的Windows JAVA_HOME设置:

options(java.home="C:\\Program Files\\Java\\jre7\\")
library(rJava)

Answer 4

最后一个问题有一个简单的答案:

> .Machine$sizeof.pointer
[1] 8

意思是我正在运行R64.如果我运行32位R它将返回4.仅仅因为您运行64位操作系统并不意味着您将运行64位R,并且从错误消息中看起来您不是.

编辑:如果包有二进制文件,那么它们在不同的目录中.具体细节取决于操作系统.请注意,...rJava/libs/x64/... 在我的MacOS系统中尝试查找dll时发生了LoadLibrary错误... rJava/libs/...`文件夹有3个子目录:i386,ppc和x86_64.(ppc文件显然是无用的行李.)

Answer 5

对不起死灵。我有太多遇到同样的问题，并发现，rJava预计JAVA_HOME到指向JRE。如果您安装了 JDK，那么您很可能会JAVA_HOME指向 JDK。我的快速解决方案：

Sys.setenv(JAVA_HOME=paste(Sys.getenv("JAVA_HOME"), "jre", sep="\\"))