我需要找到三列中大于另一列中的值的最小值。假设这五个人在一年中的不同月份入院,他们在住院前后曾多次心脏病发作。我需要住院后第一次心脏病发作。
id<-c(100,105,108,200,205)
hosp<-c(3,5,2,6,2)
attack1<-c(1,6,3,4,1)
attack2<-c(4,7,9,10,NA)
attack3<-c(5,10,NA,NA,NA)
out<-c(7,12,11,12,9)
data <- data.frame(id,hosp,attack1,attack2,attack3,out)
id hosp attack1 attack2 attack3 out
1 100 3 1 4 5 7
2 105 5 6 7 10 12
3 108 2 3 9 NA 11
4 200 6 4 10 NA 12
5 205 2 1 NA NA 9
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所以数据最终应该看起来像这样
id hosp attack1 attack2 attack3 out afterh
1 100 3 1 4 5 7 4
2 105 5 6 7 10 12 6
3 108 2 3 9 NA 11 3
4 200 6 4 10 NA 12 10
5 205 2 1 NA NA 9 NA
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这是我的尝试,但没有成功:
min_f<-function(a){
x<-min(a[a>hosp])
}
data %>% mutate_if(vars(attack1,attack2,attack3),min_f())
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您可以使用以下解决方案。
attackhosp每行中相应值的值,并且由于您正在寻找第一个大于hosp我使用first函数来提取该值的值..2hosp还指每行中第二个变量的值library(dplyr)
library(purrr)
data %>%
mutate(afterh = pmap_dbl(., ~ {x <- c(...)[3:5];
first(sort(x[x > ..2]))}))
id hosp attack1 attack2 attack3 out afterh
1 100 3 1 4 5 7 4
2 105 5 6 7 10 12 6
3 108 2 3 9 NA 11 3
4 200 6 4 10 NA 12 10
5 205 2 1 NA NA 9 NA
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作为亲爱的 @Greg 先生在非常大的数据集中提到的替代方案,我们可以使用min函数代替first(sort))组合来确保以下解决方案的评估时间更快。如果没有大于hosp最后一行min函数返回的值Inf,因此我确保它会返回该值,0而不是您可以使用您喜欢的值更改它:
data %>%
mutate(afterh = pmap_dbl(., ~ {x <- c(...)[3:5];
out <- min(x[x > ..2], na.rm = TRUE);
if(!is.finite(out)) 0 else out}))
id hosp attack1 attack2 attack3 out afterh
1 100 3 1 4 5 7 4
2 105 5 6 7 10 12 6
3 108 2 3 9 NA 11 3
4 200 6 4 10 NA 12 10
5 205 2 1 NA NA 9 0
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