在 R 中，在带有空格和命令行参数的路径中调用外部程序

Question

这里有一系列令人沮丧的问题。本质上我希望 R 使用命令行参数打开外部程序。我目前正在尝试在 Windows 机器上实现它，理想情况下它可以跨平台工作。

程序（chimera.exe）位于包含空格的目录中：C:\Program Files\Chimera1.15\bin\ 命令行选项可以是例如--nogui标志和脚本名称，因此我将从 shell 中编写（除了空间特定之外）：

C:\Program Files\Chimera1.15\bin\chimera.exe --nogui scriptfile

如果我进入 windows cmd.exe 到目录本身并只需键入chimera.exe --nogui scriptfile

现在在 R 中：

我一直在使用shell()、shell.exec()和system()，但本质上我失败了，因为空格和/或路径分隔符。

大多数时候，无论出于何种原因，system() 都会打印“127”：

> system("C:/Program Files/Chimera1.15/bin/chimera.exe")
[1] 127`

后/前斜杠使问题进一步复杂化，但无法使其发挥作用：

> system("C:\Program Files\Chimera1.15\bin\chimera.exe")
Error: '\P' is an unrecognized escape in character string starting "C\P"

> system("C:\\Program Files\\Chimera1.15\\bin\\chimera.exe")
[1] 127

> system("C:\\Program\ Files\\Chimera1.15\\bin\\chimera.exe")
[1] 127

> system("C:\\Program\\ Files\\Chimera1.15\\bin\\chimera.exe")
[1] 127

当我将程序安装在没有空格的目录中时，它可以工作。如何转义或传递system()相关命令中的空格，或者如何调用该程序？

Answer 1

尝试一下system2，因为它不使用cmd行处理器并使用r"{...}"以避免双反斜杠。假设 R 4.0 或更高版本。请?Quotes参阅 参考资料 引用语法的完整定义。

chimera <- r"{C:\Program Files\Chimera1.15\bin\chimera.exe}"
system2(chimera, c("--nogui",  "myscript"))

例如，这对我有用（您可能需要更改路径）：

R <- r"{C:\Program Files\R\R-4.1\bin\x64\Rgui.exe}"  # modify as needed
system2(R, c("abc", "def"))

当 Rgui 启动时，我们可以通过在新的 R 实例中运行它来验证参数是否已传递：

commandArgs()
## [1] "C:\\PROGRA~1\\R\\R-4.1\\bin\\x64\\Rgui.exe"
## [2] "abc"                                       
## [3] "def"   

系统

或者使用system但在路径周围加上引号，以便cmd正确解释它——如果将其输入到 Windowscmd行中，则也需要引号。

system(r"{"C:\Program Files\Chimera1.15\bin\chimera.exe" --nogui myscript}")